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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian酶试剂盒Takara

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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634485 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian 24 Rxns ￥30,451 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
Clontech 634486 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian 48 Rxns ￥47,045 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
Clontech 634487 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian 96 Rxns ￥63,820 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
Clontech 634488 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian 192 Rxns ￥114,044 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
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带分子标签的微量样本的链特异RNA-Seq分析
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian
· 高灵敏度：可以人、大鼠或小鼠来源的250 pg-10 ng的总RNA或10-1000个细胞起始
· 添加UMI：校正来自PCR错误、重复序列以及序列错误的读取
· 用途广泛：能分析质量较差的FFPE、LCM以及cfRNA来源的样本
· 操作简便：仅需要7.5小时即可完成文库构建
· 无缝衔接Illumina测序：直接制备多达192种index的Illumina® -ready文库
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian（Pico v3）设计用于从皮克级总RNA(250 pg-10 ng)中高效制备Illumina测序文库。本试剂盒采用的技术适用于高品质、部分降解及低品质RNA（如来自于FFPE或LCM样品）。升级产品与原有SMARTer 皮克级产品相比，提升了在所有Illumina测序平台的测序性能，并且还添加特别的分子条形码（UMI），从而可以消除PCR错误或duplication以及测序偏向。
 
本试剂盒采用一体化操作流程，保留了链来源信息，在反转录和PCR扩增过程中就可以添加indexes和接头。整个流程，包括文库构建及纯化仅需约7.5小时。
该试剂盒包含SMARTer RNA Unique Dual Index Kit – 24U (Code No. 634451)。另外也可以与SMARTer RNA Unique Dual Index Kits (Code No. 634452 & 634457，可单独购买）搭配使用，最多可构建多达192种indexes文库。
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
图1. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian技术流程
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
图2. 使用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian制备文库的结构特征
 
接头序列包含：通过PCR 1反应添加的可以与Illumina流动池结合生成簇的P7、P5序列（P7以淡蓝色表示，P5以红色表示），用于区分单个lane上多个样本的Index序列（Index 1 [i7] 序列连接在P7端，Index 2 [i5]连接在P5端）。并且还包括识别测序引物区域的Read 2（紫色）和 Read 1（绿色）。通过Read 1起始得到的原始RNA的反义链序列，Read 2起始获得的是原始RNA的正义链序列。其中，通过Read 2起始时，前8个碱基是UMI（深紫色），UMI之后的3个碱基（XXX）是Pico v3 Adapter衍生的序列。
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
表 1. 不同样本起始量的分析结果。
 
以0.5、1、5和10 ng人肺FFPE组织提取的总RNA起始，采用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian制备RNA-Seq文库（均做两个重复），并使用NextSeq 500进行测序。
 
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
Technote：
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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
SMARTer Stranded RNA-Seq Pico v3:
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产品详情请点击：SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
 
 

页面更新：2021-03-22 16:10:38

cDNA合成SMARTer试剂酶试剂盒Takara

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cDNA合成SMARTer试剂
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634925 SMARTer PCR cDNA Synthesis Kit 10 Rxns ￥9,500
￥7,600 		cDNA合成SMARTer试剂 cDNA合成SMARTer试剂 cDNA合成SMARTer试剂
Clontech 634926 SMARTer PCR cDNA Synthesis Kit 20 Rxns ￥16,047
￥12,838 		cDNA合成SMARTer试剂 cDNA合成SMARTer试剂 cDNA合成SMARTer试剂
Clontech 634928 SMARTer Pico PCR cDNA Synthesis Kit 10 Rxns ￥14,446 cDNA合成SMARTer试剂 cDNA合成SMARTer试剂 cDNA合成SMARTer试剂

*红字为促销价格，促销时间: 2022年9月1日-2022年10月31日

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Code No. 产品名称
634925   SMARTer® PCR cDNA Synthesis Kit
634926   SMARTer® PCR cDNA Synthesis Kit
634928   SMARTer® Pico PCR cDNA Synthesis Kit
 
SMART即RNA模板5’末端的转换机制，该技术在cDNA第一链合成的过程中，巧妙且高效地将一段已知序列加入到合成的cDNA两端，不需要adaptor连接。这段已知序列的存在对于下游应用包括扩增、RACE和文库构建等很关键。通过多种技术来利用这些已知序列的同时，一步法SMART技术的简便性和高效性保证了很高的灵敏度，并生成和扩增全长cDNA。
 
微量的RNA样本操作
整个SMART流程是在一个tube中的单酶反应。仅需对珍贵的RNA样本做很少的处理，可有效降低潜在的降解风险。这个用户友好型的流程是简单直接的，无需adaptor连接、加尾、中间过程纯化等操作。
 
全长cDNA富集
由于cDNA合成容易受到模板RNA二级结构的影响，传统方法合成的cDNA，基因5’端通常未能全部存在保留。而SMART cDNA合成过程中，由于反转录提前终止而生成的缩短了的产物，无法与SMARTer oligonucleotide结合的，在PCR过程中无法被扩增。所以，使用SMART技术结合长距离PCR合成扩增的cDNA，是被富集的全长cDNA。此外，由于5′ SMARTer序列和修饰的oligo dT引物不会添加到基因组DNA和核糖体RNA转录的cDNA上，所以SMART技术合成的cDNA是不含有这些污染因素的。
 
高灵敏度、高效率
与传统的方法如adaptor连接方法相比，SMART技术优势之一，就是其具有更高的效率。SMART技术高效率和高灵敏度的特点，使SMART技术尤其适用于起始材料有限的情况，如显微切割组织、激光捕获细胞、活组织切片样本等。低至1-2 ng的total RNA已足够生成高度代表性的cDNA库用于各种下游应用。
 
单步操作
SMARTer 第一链cDNA合成过程中，已知通用引物序列已经添加到了cDNA两端。第一链合成后，SMARTer cDNA可以直接用于下游PCR应用。
 
■ 特点
·total RNA起始量可以低至1-2 ng
·特异性富集全长cDNA
·优化的流程以保留真实的基因表达
·简单的操作，无需DNase处理或单独的adaptor连接步骤
 
产品详情请点击：cDNA合成SMARTer试剂
 
 
 

页面更新：2019-11-05 11:12:35

小鼠T细胞受体分析酶试剂盒Takara

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小鼠T细胞受体分析
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634402 SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit 12 Rxns ￥12,665 小鼠T细胞受体分析 小鼠T细胞受体分析 小鼠T细胞受体分析
Clontech 634403 SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit 48 Rxns ￥39,921 小鼠T细胞受体分析 小鼠T细胞受体分析 小鼠T细胞受体分析
Clontech 634404 SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit 96 Rxns ￥63,453 小鼠T细胞受体分析 小鼠T细胞受体分析 小鼠T细胞受体分析
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SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit—
获得TCR-α和β链 V(D)J可变区全长序列
· 完整的V(D)J序列信息—获得TCR mRNA转录本可变区的全长序列
· TCR-α和β链—同时或单独分析TCR两个亚基的多样性
· 无需多重PCR—每次反应利用一对引物扩增相应的TCR亚基
· Illumina-ready测序文库—无需接头连接即可添加Illumina接头和index序列
 
SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit 为那些寻求对T细胞受体（TCR）库进行NGS分析的研究者提供了一种强大的新的解决方案。试剂基于5’-RACE 方法可以捕获TCR转录本完整V(D)J 可变区，可以低至10 ng 至500 ng的来源于小鼠脾脏、胸腺或PBMCs的总RNA起始，也可以1,000 至 10,000个纯化的T细胞起始。顾名思义，本试剂可以在同一实验或单独实验中获得α和β链链多样性数据。
与采用多重PCR方法研究TCR多样性不同，每轮文库扩增只使用针对不同TCR亚基的一对引物扩增，提高了效率，减少了引物二聚体形成的可能性。基于多重PCR的分析方法，众所周知容易形成与引物相关的序列特异性偏差；这些偏差在我们基于RACE的方法中不会存在，因为所有的可变区都由相同的恒定区序列引发。采用本试剂~4 h即可构建indexed文库用于Illumina平台测序。
试剂采用了SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template) 技术和LNA技术，可以无偏扩增TCR mRNA序列，并具有很高的灵敏度。
 
小鼠T细胞受体分析
图1. SMARTer 法文库构建流程及TCR多样性分析PCR策略
 
 
Technote：
点击图片查看		 小鼠T细胞受体分析    
 
产品详情请点击：小鼠T细胞受体分析
 
 

页面更新：2019-12-24 14:22:26

单细胞水平人T细胞受体分析酶试剂盒Takara

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单细胞水平人T细胞受体分析
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634431 SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit 96 Rxns ￥48,426 单细胞水平人T细胞受体分析 单细胞水平人T细胞受体分析 单细胞水平人T细胞受体分析
Clontech 634432 SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit 480 Rxns ￥149,865 单细胞水平人T细胞受体分析 单细胞水平人T细胞受体分析 单细胞水平人T细胞受体分析
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SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit—
阐明单细胞中T细胞受体Alpha-Beta 链配对
· 工作流程灵活—可以利用FACS（流式细胞术）或手动分选细胞构建 Illumina测序文库
· 易于使用—优化的index允许将96个细胞混合制成12个文库，
   并可以进一步混合在一个flow-cell lane中测序
· 灵敏度高—基于RACE方法可以检测低丰度TCR变异体
· 特异性好—完整reads，大部分reads可以比对到目标区域，提供准确链配对信息
 
尽管批量T细胞测序有助于进一步了解T细胞受体库（TCR）多样性，但是批量测序不能确定T细胞群内特定的alpha-beta 受体链配对信息。由于特定的TCR alpha-beta链配对介导抗原特异性，获得配对信息对于深入了解抗原识别，靶向免疫治疗TCR的有效设计至关重要，也有助于确立T细胞群的祖先关系。单个T细胞测序可以确定特定细胞的配对信息，但是价格可能非常昂贵并涉及复杂的分析，因为大部分方法需要对大量的细胞测序。
 
使用SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit可以解决这些问题，在SMART cDNA Synthesis中通过采用一系列indexed oligo可以将手动或FACS分选的96个样品制成12个测序pool，并且这12个pool可以进一步混合，这样所有的96个样品可以在一个flow-cell lane 中测序。与用于大量样品测序的SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit 一样，试剂采用了SMART cDNA synthesis和RACE方法，通过进一步的TCR基因特异性PCR完整捕获和扩增TCR-alpha 和TCR-beta可变区构建Illumina测序文库，为TCR测序提供了一种高灵敏度的方法。
 
如果您需要软件对采用本试剂盒构建文库测序获得的数据进行demultiplex分析，请登录SMARTer Human scTCR Demultiplexer。
 
单细胞水平人T细胞受体分析
图1. 在单细胞水平进行T细胞研究的优势。
 
Panel A. T细胞受体alpha链 (TCR-α) 和beta链组成示意图。 Panel B. 示意了难以从批量细胞测序数据中获得alpha链 (TCR-α) 和beta链配对信息。针对稀有克隆型可以分析部分细胞中的配对信息（橙色克隆型），但是对于高表达的克隆型(TCRA V2J1, TCRA V2J2, TCRB V3D1J1, TCRB V2D1J2)可能有4种配对组合。
 
单细胞水平人T细胞受体分析
图2. SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit技术流程及pooling策略。
 
Panel A. 第一链cDNA合成由dT引物（RT引物）起始，MMLV型逆转录酶（RT）会在mRNA 5’端添加几个非模板核苷酸。SMART-Seq Indexed Oligos与这几个非模板核苷酸互补结合作为模板，通过RT在第一链cDNA末端添加额外核苷酸序列（也就是模板转换步骤）。试剂盒中提供8种不同的SMART-Seq Indexed Oligo，每一个SMART-Seq Indexed Oligo中内嵌唯一的六碱基index作为细胞barcode，用于下游pooling细胞的识别。通过RT添加到cDNA末端的额外序列-被称为“SMART sequence”-作为接下来几轮PCR扩增的引物结合位点，确保只有来自于全长cDNA的序列才能被扩增。经过pool（Panel B所示）和纯化后，通过连续两轮基因特异性PCR扩增来自于TCR-α 和/或 TCR-β可变区的cDNA序列。第一轮PCR采用扩增过的双链cDNA为模板，正向引物与SMART sequence互补，同时包含Illumina Read 2序列（TCR Primer 1），反向引物与TCR-α和TCR-β的恒定区（即不变区）互补（TCR a/b Human Primer 1）。第二轮PCR以第一轮PCR产物为模板，采用的正向引物与第一轮PCR添加的Read 2 序列互补。反向引物与恒定区结合，位于PCR1 primers内侧 (TCR a/b Human Primer 2 Reverse HT Index)，扩增TCR-α和TCR-β cDNA的完整可变区及部分恒定区。正向引物和反向引物包含适用于Illumina测序平台的接头序列和index，可以将多达96个样品混合用于在一个flow-cell lane中测序。Panel B. 按列混合样品，这样每个pool中包含8个细胞，每个细胞带有不同index的SMART-Seq Indexed Oligo 。在PCR 2中通过正向和反向HT indexes的不同组合使用，可以将多样品进一步混合在一个flow-cell lane 中测序（更多信息参见User Manual）。
 
单细胞水平人T细胞受体分析
图3. 96孔板中混合细胞群的分析。
 
Panel A. 基于鉴别每孔的克隆型确定细胞种类。遗漏的7个细胞没能通过对高于阈值的TCR-α 或TCR-β的reads数分析确定克隆型。Panel B. 配对信息分析。分析获得了平板中34个细胞的TCR-αβ配对克隆型。Panel C. 以百分比展示了分析细胞的alpha，beta，或alpha-beta配对信息。遗漏的细胞没有包括在分析数据中。
 
 
Technote：
点击图片查看		 单细胞水平人T细胞受体分析   SMART human scTCR-seq：
点击图片下载		 单细胞水平人T细胞受体分析
 
产品详情请点击：单细胞水平人T细胞受体分析
 
 
视频资料：在单细胞水平对人T细胞受体库分析的解决方案

Takara Bio USA公司Dr. Ankita Das和Dr. Sarah Taylor探讨可以实现分析每个细胞中的TCRα和TCRβ链的可变区全长序列，构建测序文库的SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit。
 

页面更新：2019-12-24 14:23:48

单细胞水平人T细胞受体分析酶试剂盒Takara

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单细胞水平人T细胞受体分析
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634431 SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit 96 Rxns ￥48,426 单细胞水平人T细胞受体分析 单细胞水平人T细胞受体分析 单细胞水平人T细胞受体分析
Clontech 634432 SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit 480 Rxns ￥149,865 单细胞水平人T细胞受体分析 单细胞水平人T细胞受体分析 单细胞水平人T细胞受体分析
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SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit—
阐明单细胞中T细胞受体Alpha-Beta 链配对
· 工作流程灵活—可以利用FACS（流式细胞术）或手动分选细胞构建 Illumina测序文库
· 易于使用—优化的index允许将96个细胞混合制成12个文库，
   并可以进一步混合在一个flow-cell lane中测序
· 灵敏度高—基于RACE方法可以检测低丰度TCR变异体
· 特异性好—完整reads，大部分reads可以比对到目标区域，提供准确链配对信息
 
尽管批量T细胞测序有助于进一步了解T细胞受体库（TCR）多样性，但是批量测序不能确定T细胞群内特定的alpha-beta 受体链配对信息。由于特定的TCR alpha-beta链配对介导抗原特异性，获得配对信息对于深入了解抗原识别，靶向免疫治疗TCR的有效设计至关重要，也有助于确立T细胞群的祖先关系。单个T细胞测序可以确定特定细胞的配对信息，但是价格可能非常昂贵并涉及复杂的分析，因为大部分方法需要对大量的细胞测序。
 
使用SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit可以解决这些问题，在SMART cDNA Synthesis中通过采用一系列indexed oligo可以将手动或FACS分选的96个样品制成12个测序pool，并且这12个pool可以进一步混合，这样所有的96个样品可以在一个flow-cell lane 中测序。与用于大量样品测序的SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit 一样，试剂采用了SMART cDNA synthesis和RACE方法，通过进一步的TCR基因特异性PCR完整捕获和扩增TCR-alpha 和TCR-beta可变区构建Illumina测序文库，为TCR测序提供了一种高灵敏度的方法。
 
如果您需要软件对采用本试剂盒构建文库测序获得的数据进行demultiplex分析，请登录SMARTer Human scTCR Demultiplexer。
 
单细胞水平人T细胞受体分析
图1. 在单细胞水平进行T细胞研究的优势。
 
Panel A. T细胞受体alpha链 (TCR-α) 和beta链组成示意图。 Panel B. 示意了难以从批量细胞测序数据中获得alpha链 (TCR-α) 和beta链配对信息。针对稀有克隆型可以分析部分细胞中的配对信息（橙色克隆型），但是对于高表达的克隆型(TCRA V2J1, TCRA V2J2, TCRB V3D1J1, TCRB V2D1J2)可能有4种配对组合。
 
单细胞水平人T细胞受体分析
图2. SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit技术流程及pooling策略。
 
Panel A. 第一链cDNA合成由dT引物（RT引物）起始，MMLV型逆转录酶（RT）会在mRNA 5’端添加几个非模板核苷酸。SMART-Seq Indexed Oligos与这几个非模板核苷酸互补结合作为模板，通过RT在第一链cDNA末端添加额外核苷酸序列（也就是模板转换步骤）。试剂盒中提供8种不同的SMART-Seq Indexed Oligo，每一个SMART-Seq Indexed Oligo中内嵌唯一的六碱基index作为细胞barcode，用于下游pooling细胞的识别。通过RT添加到cDNA末端的额外序列-被称为“SMART sequence”-作为接下来几轮PCR扩增的引物结合位点，确保只有来自于全长cDNA的序列才能被扩增。经过pool（Panel B所示）和纯化后，通过连续两轮基因特异性PCR扩增来自于TCR-α 和/或 TCR-β可变区的cDNA序列。第一轮PCR采用扩增过的双链cDNA为模板，正向引物与SMART sequence互补，同时包含Illumina Read 2序列（TCR Primer 1），反向引物与TCR-α和TCR-β的恒定区（即不变区）互补（TCR a/b Human Primer 1）。第二轮PCR以第一轮PCR产物为模板，采用的正向引物与第一轮PCR添加的Read 2 序列互补。反向引物与恒定区结合，位于PCR1 primers内侧 (TCR a/b Human Primer 2 Reverse HT Index)，扩增TCR-α和TCR-β cDNA的完整可变区及部分恒定区。正向引物和反向引物包含适用于Illumina测序平台的接头序列和index，可以将多达96个样品混合用于在一个flow-cell lane中测序。Panel B. 按列混合样品，这样每个pool中包含8个细胞，每个细胞带有不同index的SMART-Seq Indexed Oligo 。在PCR 2中通过正向和反向HT indexes的不同组合使用，可以将多样品进一步混合在一个flow-cell lane 中测序（更多信息参见User Manual）。
 
单细胞水平人T细胞受体分析
图3. 96孔板中混合细胞群的分析。
 
Panel A. 基于鉴别每孔的克隆型确定细胞种类。遗漏的7个细胞没能通过对高于阈值的TCR-α 或TCR-β的reads数分析确定克隆型。Panel B. 配对信息分析。分析获得了平板中34个细胞的TCR-αβ配对克隆型。Panel C. 以百分比展示了分析细胞的alpha，beta，或alpha-beta配对信息。遗漏的细胞没有包括在分析数据中。
 
 
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视频资料：在单细胞水平对人T细胞受体库分析的解决方案
Takara Bio USA公司Dr. Ankita Das和Dr. Sarah Taylor探讨可以实现分析每个细胞中的TCRα和TCRβ链的可变区全长序列，构建测序文库的SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit。
 

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