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SMART-Seq v4 3’DE Kit酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

SMART-Seq v4 3’DE Kit
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	635040	SMART-Seq v4 3’ DE Kit	96 Rxns	￥48,565
Clontech	635041	SMART-Seq v4 3’ DE Kit	192 Rxns	￥90,089

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SMART-Seq v4 3’DE Kit—简便的高性能单细胞差异表达分析

· 升级的SMART技术—带有LNA修饰的SMART-Seq v4 oligo 加升级的配方带来更好的性能    (灵敏度高，更好重复性，更多的GC-rich基因) · 末端捕获流程—大部分reads集中于3’端，同时维持出色的灵敏度，缩减了差异表达分析需要    的reads数 · 高达12个样品pool—内嵌的indexes作为细胞barcode，可以实现在每个测序lane中高达12个样品    的pool，进一步缩短时间，降低成本   单细胞转录组研究对于研究细胞群内不同单细胞表达情况非常重要。Takara Clontech 研发了单细胞mRNA转录本末端捕获技术，该技术侧重于3’端的末端捕获，使您可以用更少的测序reads获得高品质测序数据。本试剂同样采用了领先的SMART-Seq v4 技术，结合了SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template) 技术和LNA (Locked Nucleic Acid) 技术。 本试剂除了侧重于mRNA转录本3’端外，还包含了内嵌的indexes作为Read2的细胞barcode，可以实现在每个测序lane中高达12个样品的pool，进一步缩减了时间和研究成本。本试剂可以1–10.5 μl体系起始，依赖于Illumina Nextera® XT DNA Library Preparation Kit。本试剂设计并经验证可以用于以下测序平台的cDNA文库和测序文库制备：HiSeq®,NextSeq®,MiSeq®和MiniSeq®。   图1. 末端捕获方法简介   表1. K562单细胞pool文库主要测序数据   图2. 从K562单细胞中检测到的基因数

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页面更新：2019-12-13 10:05:00

性能卓越的单细胞mRNA分析酶试剂盒Takara

发表于2023年12月30日由whatman中国官网

性能卓越的单细胞mRNA分析
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	634888	SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing	12 Rxns	￥13,966
Clontech	634889	SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing	24 Rxns	￥23,654
Clontech	634890	SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing	48 Rxns	￥37,852
Clontech	634891	SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing	96 Rxns	￥66,839
Clontech	634892	SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing	192 Rxns	￥116,774
Clontech	634893	SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing	480 Rxns	￥232,084

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SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing

· SMART-Seq2 和 LNA 技术完美结合—LNA技术提高了模板转换效率 · 灵敏度高—可以单细胞或10 pg总RNA起始（起始量： 1-1,000 个细胞或10 pg-10 ng 总RNA) · 高质量测序数据—检测更多基因，保留全长信息，低rRNA比率，高GC-rich转录本代表性 · 适用于多种测序平台—cDNA文库兼容Illumina或Ion Torrent NGS平台 · 操作简便—直接以细胞起始的单管操作流程，有利于保留样品的完整信息   SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing 是第4代的SMARTer Ultra Low 试剂，也是Clontech目前灵敏很高的单细胞和微量样品mRNA-seq 试剂。试剂结合了SMART-Seq2和LNA（locked nucleic acid）技术，将SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template)技术推向了新水平，称为“SMARTer-seq® Chemistry”。基于此，本试剂的表现超越了SMART-Seq2技术和前几代的SMARTer 试剂，可以检测更多的转录本。 Clontech不断创新的传统赋予了本试剂不断提升的性能，可以1-1,000个细胞（或低至10 pg-10 ng总RNA）直接起始进行cDNA合成，并获得高重复再现性，均一的转录本覆盖度和出色的GC-rich转录本代表性的测序结果。利用本试剂制备的全长cDNA文库，可以兼容Illumina® 和 Ion Torrent 测序平台。 本试剂的核心技术-SMART技术，是非常强大的全转录组研究技术，包括细胞内剪接点，可变剪接事件研究，并提供全长信息。Oligo(dT)可以从高品质总RNA(RIN >8)或完整细胞中捕获扩增mRNA，LNA技术提升了模板转换效率，使得本试剂可以检测到比以往SMARTer Ultra Low kit更多的基因。

图1. SMART-Seq v4 模板转换机制

表1. 1、100、1000个Hela细胞主要mRNA-Seq数据 (Illumina® MiSeq® platform)

图2. 转录本覆盖度分析

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页面更新：2019-12-23 13:42:44

高灵敏度的单细胞全长mRNA分析酶试剂盒Takara

发表于2023年12月30日由whatman中国官网

高灵敏度的单细胞全长mRNA分析
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	634470	SMART-Seq Single Cell Kit	12 Rxns	￥13,341
Clontech	634471	SMART-Seq Single Cell Kit	48 Rxns	￥37,759
Clontech	634472	SMART-Seq Single Cell Kit	96 Rxns	￥65,697

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高灵敏度的单细胞全长mRNA分析 SMART-Seq Single Cell Kit
· 简便的工作流程-可以FACS或其他方法分选的单细胞起始 · 灵敏度高、一致性好-非常适用于单细胞（尤其是RNA含量非常低的细胞和细胞核）RNA-Seq的研究，可检测更多基因 · 可靠的全长cDNA制备Kit-优于许多现有的单细胞全长cDNA合成方法，例如SMART-Seq2 · 高度灵活的工作流程-可与自动化设备兼容
SMART-Seq Single Cell Kit（SSsc）是一个具有高灵敏度和可再现的cDNA制备试剂盒，适用于单细胞和细胞核的RNA-Seq分析。该试剂盒可以从已知具有低RNA含量的单个细胞（例如，PBMC）直接生成高质量的全长cDNA。该试剂盒基于SMART-Seq技术进行优化改良，具有更高的灵敏度和再现性。远远超过许多现有的单细胞全长cDNA合成方法，例如SMART-Seq2和Takara Bio现有试剂盒（SMART-Seq V4）。
图1. 与Smart-seq2法的比较
以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库，分别采用SMART-Seq Single Cell Kit（SSsc,18个重复）和Smart-seq2法（Smart-seq2，20个重复）合成cDNA（均进行19个PCR循环扩增），然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析（所有样本都均一化至1.75M paired-end reads）。
Panel A cDNA的制备方法不同，结果也不同。相比而言，Smart-seq2结果中比对到线粒体基因组的比率较高，而检测到基因鉴别的reads数相对较少。
Panel B SMART-Seq Single Cell Kit能检测到比Smart-seq2更多的基因。
图2. 与SMART-Seq v4的比较
Panel A 以淋巴母细胞系GM22601单细胞为样本制备文库，分别采用SMART-Seq Single Cell Kit（SSsc）和SMART-Seq v4（SSv4）合成cDNA（均用19个PCR循环扩增）。所有样本都均一化至1.25M paired-end reads。使用SSsc建库，能获得更高的文库产量。
Panel B 从一位健康供体收集到约50个PMBC单细胞，分别采用SSv4 和 SSsc制备cDNA，然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。不论测序深度如何，SMART-Seq Single Cell Kit检测的基因数均是SMART-Seq v4的1.6倍以上。
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页面更新：2020-05-19 13:30:55