Thermo NE-PER™ 细胞核和细胞质提取试剂 分子生物试剂78833

Thermo NE-PER™ 细胞核和细胞质提取试剂 分子生物试剂

  • 产品型号:  78833
  • 简单描述
  • Thermo NE-PER™ 细胞核和细胞质提取试剂Thermo Scientific NE-PER 细胞核和细胞质提取试剂盒可在不到两小时内高效裂解细胞并提取单独的细胞质和细胞核蛋白组分。
详细介绍

Thermo NE-PER™ 细胞核和细胞质提取试剂


Thermo Scientific NE-PER 细胞核和细胞质提取试剂盒可在不到两小时内高效裂解细胞并提取单独的细胞质和细胞核蛋白组分。

NE-PER 细胞核和细胞质提取试剂盒的特点:

快速 — 可在不到两小时内获得细胞核和细胞质组分
经验证 — NE-PER 试剂盒已在超过950种zhi名出版物中引用
通用 – 来自培养细胞或组织的细胞核蛋白(仅适用于新鲜样品)
可扩展 — 具有两种试剂盒规格,用于从细胞和组织中生成提取物
便利 — 指示简单,无需梯度超速离心
可兼容 — 可用于下游测定,包括 Western 免疫印迹、凝胶迁移率测定、蛋白测定、报告基因测定和酶活性测定

NE-PER 试剂盒是一种核蛋白提取方法,涉及简单、逐步裂解细胞并离心分离细胞核和细胞质蛋白组分。只需要使用台式微量离心机、试管和移液器工具。NE-PER 试剂可将各种细胞质和细胞核蛋白高效溶解并分离为小份,使基因组 DNA 和 mRNA 的交叉污染或干扰极少。脱盐或稀释后,分离的蛋白可用于进行免疫检测以及蛋白相互作用实验,如迁移率变动分析 (EMSA)、免疫共沉淀 (Co-IP) 和沉淀分析。

有多种方法可用于分离细胞核并制备细胞核蛋白提取物。大多数制备细胞核提取物的方法都是繁琐的流程,需要可能影响细胞核蛋白完整性的机械均质化、冻/融循环、广泛的离心或透析步骤。NE-PER 细胞核和细胞质提取试剂盒是一种基于试剂的方案,可逐步裂解细胞、从完整的细胞核中分离细胞质,然后从基因组 DNA 和 mRNA 中提取出细胞核蛋白。在使用培养细胞时,这一温和的流程只需不到两小时并且只需要一台标准的台式离心机。此外,可以从同一细胞培养或组织样品中回收活性细胞核蛋白和细胞质蛋白。

该试剂盒通常可从200万个细胞中产生 200-500 µg 细胞质蛋白和 100-200 µg 细胞核蛋白(浓度为 1 mg/mL)。细胞溶质和细胞核部分间的典型交叉污染率为大约 10%。该方法主要从细胞核中回收可溶性蛋白,而不是在染色质中结合的蛋白或细胞核包膜的整合膜蛋白。细胞核提取物的蛋白浓度可通过在提取中采用不同体积的细胞核提取试剂 (NER) 很容易的进行控制,提取效率不会有任何重大损失。从细胞中特定提取各种细胞核蛋白对于很多基因调控研究的成功非常重要。尽管有多种方法可用于分离细胞核并制备细胞核蛋白提取物,但这些方法的大多数都很繁琐,需要采用可能影响很多脆弱细胞核蛋白完整性的机械均质化、冻/融循环、广泛的离心或透析步骤。NE-PER 试剂盒克服了这些问题,可为 EMSA 和其他分析技术提供高质量、浓缩的细胞核蛋白提取物。



Thermo NE-PER™ 细胞核和细胞质提取试剂


规格

数量
15 mL
运输条件
环境
Buffer
裂解缓冲液
形式
液体
产品线
NE-PER™
试剂类型
细胞裂解缓冲液、去污剂溶液、亚细胞分离
产品类型
细胞核和细胞质提取试剂

内容与储存

接收后,试剂盒组分在 4°C 下储存。


凯杰Qiagen QIAcube HT Plasticware 试剂 分子生物试剂950067

凯杰Qiagen QIAcube HT Plasticware 试剂 分子生物试剂

  • 产品型号:  950067
  • 简单描述
  • 凯杰Qiagen QIAcube HT Plasticware 试剂用于从动物样本自动、高通量分离病毒RNA、DNA和细菌DNA 简便可靠的自动化处理,省时且经济同时兼容病毒RNA、DNA和细菌DNA样本的通用型仪器实验方案 适于包括全血、血清和组织的多种样本类型能够高效去除抑制剂和污染物
详细介绍

凯杰Qiagen QIAcube HT Plasticware 试剂


  • 核酸纯化产物可直接用于real-time PCR或RT-PCR分析

在QIAcube HT仪器上使用cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit,可从大量的动物样本中方便地自动分离病毒RNA、DNA和细菌DNA。其采用成熟的QIAamp硅胶膜技术,以96孔板的形式方便地去除污染物和抑制剂,获得可直接用于下游分析的优质病原体核酸。

性能

cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit能从包括全血、血清、血浆、体液、拭子、洗液、组织和粪便等在内的不同的动物样本中快速、可靠地自动纯化病毒RNA、DNA和细菌DNA。其所获得的优质核酸可以直接用于多种敏感的下游应用。 

该试剂盒可从未经稀释的动物全血样本简便、快速地纯化核酸,同时能*限度控制硅胶膜堵塞的风险。其以96孔板形式进行自动样本处理,精确度佳且不同工作日、不同纯化操作之间具有良好的可重复性,不仅使用方便,而且令人放心(参见Highly repeatable viral RNA isolation)。 

QIAcube HT仪器与cador Pathogen QIAcube HT Kit配合使用,能够用同通用实验方案,同时从大量样本中纯化不同核酸产物。病毒RNA与细菌DNA的共纯化步骤简单可靠,能够获得与QIAamp cador Pathogen Mini Kit手动纯化操作同等质量的核酸(参见Co-isolation of viral RNA and bacterial DNA)。与其他供应商的试剂盒相比,cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit性能十分突出,甚至在其它试剂盒无法克服的困难条件下也能成功进行分离操作(参见High performance protocol)。

凯杰Qiagen QIAcube HT Plasticware 试剂

原理

cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit能够自动纯化病原体核酸(病毒RNA、DNA和细菌DNA),在使用QIAcube HT仪器时至多可处理200 μl的动物全血、血清、血浆、拭子或洗液。通过应用cador Pathogen 96 QIAcube HT手册所述的预处理方法,该试剂盒也可用于组织和粪便样本。此操作能够制备优质的DNA和RNA样本,可用于下游的PCR、RT-PCR及其它应用。 

cador Pathogen 96 QIAcube HT Kit整合了硅胶膜的选择性结合能力与96孔板的高通量处理能力,更具备全自动设计,能同时在QIAcube HT仪器上处理24–96个样本。



Detachin细胞解离试剂,胰蛋白酶替代剂T100100

Detachin细胞解离试剂,胰蛋白酶替代剂

  • 产品型号:  T100100
  • 简单描述
  • Detachin细胞解离试剂,胰蛋白酶替代剂品牌:genlantis规格:100ml产地:美国USA
详细介绍

Detachin细胞解离试剂,胰蛋白酶替代剂

产品特点:

  1. 温和快速解离试剂
  2. 比胰酶解离获得更高的细胞存活率
  3. 对各种不同的细胞均有效
  4. 不含哺乳类或细菌类成分
  5. +4C保存2个月有效
  6. 对解离的细胞不需冲洗
  7. 清除污染和足迹的有效方法
  8. 保护未使用的Detachin保存更长久的时间
  • Gentle and rapid detachment
  • Maximum cell viability over Trypsin – Money Back Guarantee
  • Effective on a wide range of cells
  • No mammalian or bacterial byproducts
  • Stable at 4C for 2 months
  • No need to wash detached cells
  • Convenient format that reduces contamination and footprint
  • Preserve unused Detachin for longer term storage


Detachin细胞解离试剂,胰蛋白酶替代剂

Storage:
Store at -20C. Can be stored at 4C after thawing for up to two months.

保存:

-20C保存,+4C保存2个月。

订购信息:

Detachin Cell Detachment Solution
100 ml, T100100

6 x 50 ml, T100106

10 x 100 ml, T100110

详细产品信息:

1.

Detachin Cell Detachment Solution is a superior alternative to Trypsin/EDTA for gently detaching adherent cells from in vitro growth vessels. Detachin provides quick, gentle, and effective detachment of a wide variety of adherent cells, including primary cells, from all known tissue culture plastic ware.

Detachin细胞解离试剂是一个更好的替代胰酶/EDTA的温和细胞解离试剂,可以温和的将贴壁细胞从体外培养容器上解离下来。Detachin拥有快速、温和、对各种贴壁细胞(包括原代细胞)均有效的特点,可以从已知的所有的组织培养容器上解离。

2.

Detachin Cell Detachment Solution provides quick and gentle detachment and dissociation of a wide variety of adherent cells grown in all known tissue culture plasticware. The Detachin Solution contains protease, and collagenase activities in an isotonic, phosphate buffer solution with EDTA and is a much better alternative than Trypsin/EDTA. Due to its popularity, Genlantis is introducing a new Detachin format containing 6 x 50 ml tubes of Detachin. This Detachin format is Packaged for Additional Convenience, or 6-PAC, and will provide users with optimal convenience and handling. The Detachin 6-PAC format allows users to preserve unused portions of Detachin for the long term, reduce the chance of contamination of Detachin stock, and reduce footprint of Detachin in tissue culture hoods.

Detachin细胞解离试剂可以从已知的所有组织培养塑料器皿上温和快速的解离各种贴壁细胞。Detachin含有蛋白酶、等渗胶原酶、含EDTA的磷酸盐缓冲液,是较胰酶/EDTA更好的选择。鉴于Detachin的大受欢迎,Genlantis推出了6 x 50 ml的包装。该包装使得Detachin的使用更加方便,取名为6-PAC,为使用者带来*的简便操作。这种包装形式使得使用者可以对未使用Detachin保存更久的时间,降低库存Detachin的被污染的几率,降低在组织培养器皿中Detachin的残留。

3.

With the Detachin Cell Detachment Solution, you will get a novel solution that provides consistent, safe, and efficient results. It has been tested successfully on a wide variety of different cells and cell types like bone marrow stem, fibroblasts, hepatocytes, mouse germ, keratinocytes, A-375, BHK, CHO, COS , D54, HEK 293, HeLa, and many many others. Experience the high performance and convenience of Detachin by ordering your solution today!

使用Detachin细胞解离试剂,你可以得到创新性的方法,那就是可重复的、安全的、有效的实验结果。Detachin已经在很多不同种类细胞以及像骨髓干、纤维母细胞、肝细胞、小鼠生殖、角质细胞、A-375、BHK、 CHO、COS、D54、HEK 293、HeLa等其他很多细胞类型成功测试

毒胡萝卜素Thapsigargin sigma试剂价格sigma代理 T9033

毒胡萝卜素Thapsigargin sigma试剂价格

  • 产品型号:  sigma代理 T9033
  • 简单描述
  • Thapsigargin≥98% (HPLC), solid film solubility:DMSO: soluble ethanol: soluble
详细介绍

Biochem/physiol Actions

Potent, cell-permeable, IP3-independent intracellular calcium releaser. Blocks the transient increase in intracellular Ca2+ induced by angiostatin and endostatin. Induces apoptosis by disrupting intracellular free Ca2+ levels; incorporated into chemotherapeutic prodrug formulations.

 

Monarch DNA/RNA 保护试剂 货 号 #T2011LNEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 核酸纯化 – RNA提取和纯化

Monarch DNA/RNA 保护试剂                              收藏

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#T2011L
56 ml
1,179.00

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Monarch总RNA小量提取酶试剂(含DNase I蛋白酶K和缓冲液)
Monarch RNA 结合缓冲液
Monarch RNA 漂洗缓冲液

性能

 可应用于各种类型样本
 纯化回收几乎所有片段大小的 RNA,包括 miRNA 和 > 20 nt 的小 RNA
 提供 DNase I、gDNA 去除离心柱、蛋白酶 K 和稳定试剂

概述

Monarch 总 RNA 小量提取试剂盒是一款提取并纯化总 RNA 的全能解决方案试剂盒,能做到样本保存、细胞裂解、gDNA 去除,适用于各种生物样本,如培养细胞、血液和哺乳动物组织,也适用于难裂解样本,如细菌、酵母和植物,只要增加一步来提高裂解效率。该试剂盒还可以用于纯化、酶学反应后的样本或者 TRIzol® 提取的样本,提取纯化后的 RNA 具有极高质量:A260/280 和 A260/230 比值均 ≥1.8、高 RIN 值和无 gDNA 残留;并且 RNA 片段包含完整的 miRNAs 和完整的 rRNAs。另外,改变结合条件可以选择性地筛选小于 200 nt 的 RNA,包含miRNA、5S rRNA 和 tRNA。提取纯化得到的 RNA 可用于 RT-qPCR、
cDNA 合成、RNA-seq、Northern blot 分析等下游实验。

特性

• 结合能力:100 µg RNA
• RNA 大小:> 20 nt
• 纯度:A260/280 和 A260/230 ≥1.8
• 起始样本量:最多 107 或 50 mg 组织
• 洗脱体积:50-100  µl
• 得率:依样本类型而定
• 下游应用:NGS RNA 文库制备、RT-PCR、RT-qPCR 和 Northern blots

Monarch 总 RNA 小量提取试剂盒组成:

– Monarch 总 RNA 小量提取酶试剂(含 DNase I、蛋白酶 K 和缓冲液)
– Monarch 无核酸酶水
– Monarch RNA 纯化离心柱
– Monarch DNA/RNA 保护试剂
– Monarch RNA 裂解缓冲液
– Monarch RNA 结合缓冲液
– Monarch RNA 漂洗缓冲液
– Monarch gDNA 去除离心柱
– Monarch 收集管 II

Monarch总RNA小量提取酶试剂(含DNase I蛋白酶K和缓冲液) 货 号 #T2019LNEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 核酸纯化 – RNA提取和纯化

Monarch总RNA小量提取酶试剂(含DNase I蛋白酶K和缓冲液)                              收藏

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#T2019L
1 包
809.00

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性能

 可应用于各种类型样本
 纯化回收几乎所有片段大小的 RNA,包括 miRNA 和 > 20 nt 的小 RNA
 提供 DNase I、gDNA 去除离心柱、蛋白酶 K 和稳定试剂

概述

Monarch 总 RNA 小量提取试剂盒是一款提取并纯化总 RNA 的全能解决方案试剂盒,能做到样本保存、细胞裂解、gDNA 去除,适用于各种生物样本,如培养细胞、血液和哺乳动物组织,也适用于难裂解样本,如细菌、酵母和植物,只要增加一步来提高裂解效率。该试剂盒还可以用于纯化、酶学反应后的样本或者 TRIzol® 提取的样本,提取纯化后的 RNA 具有极高质量:A260/280 和 A260/230 比值均 ≥1.8、高 RIN 值和无 gDNA 残留;并且 RNA 片段包含完整的 miRNAs 和完整的 rRNAs。另外,改变结合条件可以选择性地筛选小于 200 nt 的 RNA,包含miRNA、5S rRNA 和 tRNA。提取纯化得到的 RNA 可用于 RT-qPCR、
cDNA 合成、RNA-seq、Northern blot 分析等下游实验。

特性

• 结合能力:100 µg RNA
• RNA 大小:> 20 nt
• 纯度:A260/280 和 A260/230 ≥1.8
• 起始样本量:最多 107 或 50 mg 组织
• 洗脱体积:50-100  µl
• 得率:依样本类型而定
• 下游应用:NGS RNA 文库制备、RT-PCR、RT-qPCR 和 Northern blots

Monarch 总 RNA 小量提取试剂盒组成:

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NEBNext® Single Cell Lysis Module 货 号 #E5530SNEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于Illumina测序平台: 模块和酶

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#E5530S
96 reactions
1,239.00

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Description

NEBNext® Single Cell Lysis Module            货   号                  #E5530S 

Prpduct Information

 NEBNext® Single Cell Lysis Module            货   号                  #E5530S

Properties and Usages

 NEBNext® Single Cell Lysis Module            货   号                  #E5530S

NEBNext ChIP-Seq 文库制备试剂盒(停产) 货 号 #E6200LNEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/Ultra II DNA & RNA

NEBNext ChIP-Seq 文库制备试剂盒(停产)                              收藏

货 号
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#E6200L
60 次反应
19,689.00

#E6200S
12 次反应
4,929.00

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概述

该产品已停产,推荐替代产品为  NEBNext ChIP-Seq  文库制备预混液试剂盒(NEB#6240) 或  NEBNext Ultra II DNA 文库制备试剂盒(NEB#7645)

 

请登陆 NEBNextSelector.neb.com 可以使用在线产品选择工具进行产品选择。

NEBNext ChIP-Seq 文库制备预混液试剂盒(停产) 货 号 #E6240LNEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/Ultra II DNA & RNA

NEBNext ChIP-Seq 文库制备预混液试剂盒(停产)                              收藏

货 号
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#E6240L
60 次反应
13,689.00

#E6240S
12 次反应
3,429.00

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停产通知

 “该产品已停产,推荐替代产品为 NEBNext Ultra II DNA 文库制备试剂盒(NEB #E7645)或 NEBNext Ultra II DNA 文库制备试剂盒-含纯化磁珠(NEB #E7103)或 NEBNext 末端修复模块(NEB #E6050)或 NEBNext 加 dA 尾模块(NEB #E6053)”

概述

The NEBNext ChIP-Seq Library Prep Master Mix Set for Illumina contains reagents for preparation of

libraries for next-generation sequencing on the Illumina platform from 10 ng of ChIP DNA, in a standard workflow. Please note that adaptors and primers are not included in the kit and are available separately.

NEBNext ChIP-Seq 文库制备预混液试剂盒(停产)            货   号                  #E6240L

NEBNext DNA 文库制备试剂——订购信息

NEBNext ChIP-Seq 文库制备预混液试剂盒(停产)            货   号                  #E6240L 

适用于所有平台的试剂

NEBNext ChIP-Seq 文库制备预混液试剂盒(停产)            货   号                  #E6240L

 

请登陆 NEBNextSelector.neb.com 可以使用在线产品选择工具进行产品选择。

 

NEBNext® 免疫测序试剂盒(人) 货 号 #E6320LNEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/免疫测序

NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)                              收藏

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#E6320L
96 次反应
69,119.00

#E6320S
24 次反应
20,159.00

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相关产品

 NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)

产品特点

 • 通过对受体序列的深入分析,揭示复杂的免疫系统

对 B 细胞受体(BCR)和 T 细胞受体(TCR)进行富集和测序
制备 B 细胞和 T 细胞的全长免疫基因组库
使用唯一分子标签序列(UMI)准确定量转录本
使用用于生物信息流程(教程)的开源软件工具——pRESTO 分析数据
 

产品说明

 概述

免疫组库测序常常用来分析当下的和过去的免疫应答反应。最常应用领域包括:自身免疫性疾病的表征、肿瘤学、传染病中和抗体的发现、肿瘤浸润淋巴细胞以及用作研究残留病的工具。二代测序(NGS)平台在读长和通量方面的最新进展促进了免疫组库测序的发展。

 
NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)通过对 B 细胞和 T 细胞全长免疫组库分析,能获得体细胞的所有突变信息。该试剂盒提供引物模块,可用于分析完整的 V、D、J 区域和 IgM、IgD、IgG、IgA、IgE 亚类,并分析 BCR 轻链、BCR 重链、TCRα 链和 TCRβ 链。该试剂盒还提供唯一分子标签序列(UMI),将来源于同一个分子的 PCR 产物组成共有序列,以便提高测序准确性,消除 PCR 偏差。Galaxy 平台提供一个开源软件工具——pRESTO,用于在本地或云端开展超强生物信息分析。为了确保不熟悉 Galaxy 平台的用户能成功使用分析软件,pRESTO 提供教学教程。
 
抗体和 TCR 结构的简化示意图:
NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)            货   号                  #E6320L
 
 
免疫组建库流程:
NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)            货   号                  #E6320L
 
产品描述
NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)            货   号                  #E6320L
使用唯一分子标签序列(UMI)实现克隆型的精准检测。比较克隆型频率:使用 10 ng 和 100 ng T 细胞总 RNA 制备人类 TCR 文库,在有或没有 UMI 情况下分别建库。根据有 UMI 的测序结果,对前 100 个高表达克隆型进行排序。重复建库,克隆型频率重叠绘制于图中。每个条形或圆点代表一个克隆,该克隆经过总读长分析或使用 UMI 过滤。使用 UMI 可对原始样本中的起始 RNA 分子进行绝对定量。当将克隆按照富集度从高到底进行排序,没有 UMI 的数据会导致 PCR 或测序扩增的偏差,从而误导样本中克隆型频率的分析。UMI 的使用通过对起始样本中 RNA 的绝对定量来校正偏差。使用 UMI 也可以在重复本之间实现更好的相关性,尤其是起始量较低时。各个文库向下抽样 500,000 reads。
 
NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)            货   号                  #E6320L
使用 NEBNext 免疫测序试剂盒(人),能够在同一管中制备人 BCR 和 TCR 文库。分别使用 1 μg、100 ng 和 10 ng 人 PBMC 总 RNA(Takara Bio #636592)制备人 BCR+TCR 文库,每个起始量都做有平行实验。所有文库向下抽样 950,000 reads。使用 pRESTO 工具完成 reads 过滤、序列组装和基于 UMIs 组成共有序列。使用 MiGMAP 鉴别 V、D 和 J 区域。图(A)表示每个人类 PBMC 总 RNA 起始样本检测到的克隆型数量。图(B)表示各文库中 B 细胞链和 T 细胞链所占百分比。
 

 

NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠) 货 号 #E6330LNEB酶试剂 New England Biolabs

上海金畔生物科技有限公司代理New England Biolabs(NEB)酶试剂全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息和订购。

产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/免疫测序

NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)                              收藏

货 号
规 格
价 格(元)
北京库存
上海库存
广州库存
成都库存
苏州库存

#E6330L
96 次反应
69,119.00

#E6330S
24 次反应
20,159.00

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制备 B 细胞和 T 细胞的全长免疫基因组库
使用唯一分子标签序列(UMI)准确定量转录本
使用用于生物信息流程(教程)的开源软件工具——pRESTO 分析数据
 

产品说明

概述:

免疫组库测序常常用来分析当下的和过去的免疫应答反应。最常应用领域包括:自身免疫性疾病的表征、肿瘤学、传染病中和抗体的发现、肿瘤浸润淋巴细胞以及用作研究残留病的工具。二代测序(NGS)平台在读长和通量方面的最新进展促进了免疫组库测序的发展。

 

NEBNext® 免疫测序试剂盒(人)通过对 B 细胞和 T 细胞全长免疫组库分析,能获得体细胞的所有突变信息。该试剂盒提供引物模块,可用于分析完整的 VDJ 区域和 IgMIgDIgGIgAIgE 亚类,并分析 BCR 轻链、BCR 重链、TCRα 链和 TCRβ 链。该试剂盒还提供分子标签序列(UMI,将来源于同一个分子的 PCR 产物组成共有序列,以便提高测序准确性,消除 PCR 偏差。Galaxy 平台提供一个开源软件工具——pRESTO,用于在本地或云端开展超强生物信息分析。为了确保不熟悉 Galaxy 平台的用户能成功使用分析软件,pRESTO 提供教学教程。

 

 抗体和 TCR 结构的简化示意图:

 

 NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)            货   号                  #E6330L

 

 免疫组建库流程:

 

 NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)            货   号                  #E6330L

产品描述:

NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)            货   号                  #E6330L

使用唯一分子标签序列(UMI)实现克隆型的精准检测。在有或没有 UMI 情况下,比较小鼠 TCR 克隆型频率。根据有 UMI 的测序结果,对前 100 个高表达克隆型进行排序。在有或没有 UMI 情况下,重复建库,克隆型频率重叠绘制于图中。每个条形或圆点代表一个克隆,该克隆经过总读长分析或使用 UMI 过滤。使用 UMI 可对原始样本中的起始 RNA 分子进行绝对定量。当将克隆按照富集度从高到底进行排序,没有 UMI 的数据会导致 PCR 或测序扩增的偏差,从而误导样本中克隆型频率的分析。UMI 的使用通过对起始样本中 RNA 的绝对定量来校正偏差。使用 UMI 也可以在重复本之间实现更好的相关性,尤其是起始量较低时。各个文库向下抽样 500,000 reads

NEBNext® 免疫测序试剂盒(小鼠)            货   号                  #E6330L

使用 NEBNext 免疫测序试剂盒(小鼠),能够在同一管中制备小鼠 BCR TCR 文库。分别使用 10 ng100 ng 1,000 ng 小鼠脾脏总 RNATakara Bio #636605)制备小鼠 BCR+TCR 文库,每个起始量都做有平行实验。所有文库向下抽样 1,000,000 reads。使用 pRESTO 工具完成 reads 过滤、序列组装和基于 UMIs 组成共有序列。使用 MiGMAP 鉴别 VD J 区域。图(A)表示每个小鼠脾脏总 RNA 起始样本检测到的克隆型数量。图(B)表示各文库中 B 细胞重链(IGH)和轻链(IGK IGL)以及 链(TRA)、β 链(TRB)、δ 链(TRD)和 γ 链(TRG)所占百分比。

NEBNext单细胞/超低起始量 cDNA 合成 &扩增模块 货 号 #E6421LNEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Illumina 测序平台/Ultra II DNA & RNA

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特性

从单个细胞或 2 pg-200 ng 的总RNA 制备最高产量、最高质量的全长转录本测序文库
用于极难检测的低丰度转录本
不同起始量及样本类型,均能保证转录本检测的一致性
不同起始量及样本类型,均能获得全长转录本和均一的覆盖度
用于培养细胞、原代细胞和总 RNA 的文库制备
节省时间:采用快速、精简的工作流程,减少了操作步骤和手动操作时间
-单管完成从细胞裂解到 cDNA 的全部实验流程
-不同 GC 含量的样本,均可使用同一种酶混液、同一种反应条件同时完成 DNA 片段化、末端修复和加 dA 尾   三个步骤
提供包含或不包含文库构建的包装,为实验提供了极大的灵活性
 

 

概述

NEBNext单细胞/超低起始量 RNA 文库制备试剂盒可从单个细胞或超低起始量的RNA 构建成全长转录本的高质量文库,优化的工作流程满足了更高灵敏度、更快速的文库构建需求,该试剂盒适用于 Illumina 平台。
 
优化的 cDNA 合成和扩增步骤包含模板转换,同时采用特有的实验流程和试剂。
该方法可直接从单个细胞或 2 pg-200 ng 的 RNA 合成 cDNA,即使低丰度转录本也可获得高产量的cDNA。后续文库构建采用 NEBNext Ultra II FS DNA 片段化/末端修复/加 dA 尾试剂盒,使建库流程更简单高效
NEBNext单细胞/超低起始量 cDNA 合成 &扩增模块            货   号                  #E6421L
 
使用 NEBNext单细胞/超低起始量 RNA 文库制备试剂盒建库,能显著增加转录本检测数量。以 Jurkat 单细胞(6个重复)为样本制备文库,分别采用 NEBNext单细胞/超低起始量 RNA 文库制备试剂盒、SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA 试剂盒(Clontech #634891)及Nextera XT DNA Library Prep 试剂盒(Illumina #FC-131-1096)制备文库。文库通过 Illumina NextSeq 500(2 x 76 bp)双端测序。TPM = 每百万个千碱基长度的转录本。每个圆点代表在给定的 TPM 范围内检测到的转录本数量,框代表各个重复和不同方法的中位数、第一四分位数及第三四分位数。使用 Salmon 0.6 完成所有 GENCODE v25 转录本的比对和量化。图中显示了在以下TPM 范围内检测到的转录本数量:1-5、5-10、10-50 和>50 TPM。结果表明:使用NEBNext 文库制备方法能检测到更多的低丰度转录本。
NEBNext单细胞/超低起始量 cDNA 合成 &扩增模块            货   号                  #E6421L
 
使用 NEBNext单细胞/超低起始量 RNA 文库制备试剂盒建库,能获得更高的文库产量。以 HeLa 单细胞、Jurkat 单细胞、M1 单细胞和混有推荐量的 ERCC RNA Spike-In 混合物 IThermo Fisher Scientific® #4456740)的 10 pg人通用参考(UHRRNAAgilent #740000)为样本制备文库。分别采用 NEBNext单细胞/超低起始量 RNA 文库制备试剂盒、SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA 试剂盒(Clontech #634891)及Nextera® XT DNA 文库制备试剂盒(Illumina #FC-131-1096)制备文库。误差条表示6-11 个重复的标准差使用 NEBNext 试剂盒时,将 80% cDNA 作为起始量,用 8 PCR 循环扩增文库。使用 SMART-Seq v4/Nextera XT 建库时,采用推荐的 125 pgcDNA 作为起始量,用 12 PCR 循环扩增文库。误差条表示6-11 个重复数据的标准差

 
 

NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel 货 号 #E6627LNEB酶试剂 New England Biolabs

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产品优势

   Generate full (100%) coverage of all protein coding regions in BRCA1 and BRCA2 genes

   Obtain highly uniform sequencing across exon targets- 100% of base pairs in panel have coverage

       greater than 20% of the mean target coverage

   Maximize efficiency with a 1-day workflow that combines highly specific enrichment with library

      preparation

   Produce high depths of target coverage across a wide range of DNA input amounts for germline and

      somatic variant calling

概述

The NEBNext Direct BRCA1/BRCA2 Panel enriches the complete exon content of BRCA1 and BRCA2

genes for next-generation se­quencing analysis. NEBNext Direct employs a unique hybridization-based

enrichment workflow that hybridizes baits directly to genomic DNA, without the need for upfront library

preparation. The BRCA1/BRCA2 panel demonstrates extremely high specificity and unmatched coverage

uniformity across a wide range of DNA inputs, allowing highly sensitive calling of germline and somatic

variants while maximizing sequencer efficiency.

 

Figure 1. NEBNext Direct Workflow.

NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel            货   号                  #E6627L

 

NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel            货   号                  #E6627L

 

NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel            货   号                  #E6627L

 

试剂盒组份

NEBNext Sample Purification Beads
NEBNext Direct BRCA1/BRCA2 Baits
NEBNext Direct® Bead Prep Buffer
NEBNext Direct® Hybridization Buffer
NEBNext Direct® dA-Tailing Buffer
NEBNext Direct® Adaptor Ligation Buffer
NEBNext Direct® Cleaving Buffer  
NEBNext Direct® Hybridization Wash (HW) 
NEBNext Direct® Bead Wash 1
NEBNext Direct® Bead Wash 2 
NEBNext Direct® 3´ Adaptor  
NEBNext Direct® 5´ UMI Adaptor 
NEBNext Direct® dA-Tailing Enzyme
NEBNext Direct® Ligase  
NEBNext Direct® 5´ Blunting Enzyme Mix 
NEBNext Direct® Cleaving Enzyme Mix 
NEBNext Direct® Q5 Master Mix
NEBNext Direct® FFPE Phosphorylation Enzyme
NEBNext Direct® Streptavidin Beads 4
NEBNext Direct® Hybridization Additive -20
NEBNext Direct® 5´ Blunting Buffer 4
NEBNext Direct® 3´ Blunting Enzyme Mix

NEBNext Direct BRCA1/BRCA2 Resources

  • GRCh37hg19 Bed Files for the NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel
  • GRCh38hg38 Bed Files for the NEBNext Direct® BRCA1/BRCA2 Panel
  • Protocol for NEBNext Direct BRCA1/BRCA2 Panel (E6627)

NEBNext Direct Cancer HotSpot Panel 货 号 #E7000LNEB酶试剂 New England Biolabs

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产品优势

   可比对到目标区域的 reads 比例更高

   避免过度测序,减少每个样本的花费

   所 有 区 域 均 可 得 到 均 一 的 测 序 结果,无论 GC 含量多少

   将富集和文库制备流程相结合,1 天即可完成

   能够从有限及降解的 DNA 样品中得到高质量的文库,包括 FFPE 及 ctDNA

   区分分子重复,降低假阳性突变并提高敏感度

概述

 NEBNext Direct Cancer HotSpot Panel 采用了一种全新的靶向富集方法,使其能够高特异性的杂交捕获 50 个基因中的 190 个常见癌症靶点。NEBNext Direct 技术与传统的液相杂交及多重 PCR 方法相比有着明显的优势。靶向富集与文库制备相结合,减少了实验所需时间,同时将样本的损失降到最低。能够与自动化设备兼容的 NEBNext Direct 使得对难以成功的样本基因组中目标区域的深度测序成为可能,从而能够发现及鉴定样本中的罕见突变。

 

NEBNext Direct 采用了快速杂交实验流程,将捕获与文库构建相结合

NEBNext Direct Cancer HotSpot Panel            货   号                  #E7000L

 

目标区域包括以下癌症相关基因

NEBNext Direct Cancer HotSpot Panel            货   号                  #E7000L

 

 NEBNext Direct Cancer HotSpot Panel            货   号                  #E7000L

 

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产品详细信息

请登陆 NEBNextDirect.com 获取更多详细信息。

NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒 货 号 #E7120LNEB酶试剂 New England Biolabs

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NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物(双端检索引物)

概述

虽然重亚硫酸盐测序是研究 DNA 甲基化的金标准,但这种转化方式会对DNA 造成损伤,导致 DNA 断裂、丢失和 GC 偏嗜。NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒 (EM-seq) 提供了一种酶学方法代替全基因组重亚硫酸盐处理 DNA (WGBS) 的方法,并结合高效流程化的建库步骤,适用于 Illumina 平台测序。高效的 EM-Seq 酶促转化可最大程度地减少对DNA的损伤,结合提供的 NEBNext Ultra II 文库制备流程,最终产生的高质量文库可以从有限的测序数据中更灵敏的检测到 5-mC 5-hmC

优势

更卓越的 5-mC 5-hmC 检测灵敏度

更高的比对率

更均一的 GC 覆盖度

能从有限的测序数据检测到更多的 CpG 位点

更均一的二核苷酸分布

更长的文库插入片段

更高效的建库流程

提供转化模块

NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒            货   号                  #E7120L

产品特点

 NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒            货   号                  #E7120L

EM-Seq 能得到更高的文库产量。采用Covaris S2 仪器将 10 ng50 ng 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。上述所有起始量,EM-Seq 都能使用更少的 PCR 循环得到更高的文库产量,表明 EM-Seq 显著减少了 WGBS 方法中的 DNA 损失。误差条表示标准差。

NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒            货   号                  #E7120L

NEBNext 酶学转化法甲基化文库可获得更长的插入片段 。采用Covaris® S2 器将 50 ng NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina MiSeq (2 X 76 bases) 测序,片段大小采用 Picard 2.18.14 测定。图中绘制了每个插入片段出现的频率标准化后的数据,结果如图:EM-Seq 建库后的插入片段比 WGBS 方法得到的插入片段更长,说明:酶学转化法不会对 DNA 造成损伤,而重亚硫酸盐处理的 DNA 有严重损伤。

 

NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒            货   号                  #E7120L

 

 

相较于 WGBSEM-Seq 在更低的测序深度情况下能检测到更多的 CpG 位点,并能实现更卓越的 GC 均一覆盖度。采用Covaris S2 仪器将 10 ng, 50 ng, 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 6000 (2 X 100 bases) 测序,使用 bwa-meth 0.2.2 将 测序数据 与 hg38 进行比对。

A: CpG 位点检测:通过分析 3.24 亿双端数据得到 EM-Seq WGBS 文库的 CpG 位点覆盖度,其中每条链都独立计数,最终得到最多 5600 万个可能的 CpG 位点。结果显示:EM-Seq 在更低测序深度能检测到更多的 CpG 位点。

B: GC 覆盖度:使用 Picard 2.17.2 计算 GC 覆盖度,图中显示不同 GC 含量时 (0-100%),标准化后覆盖度的分布情况。结果显示:EM-Seq 文库显著提高 GC 覆盖度的均一性,无 AT 过度测序,也无 GC 测序不足,后两项都是 WGBS 文库的典型缺陷。

NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒            货   号                  #E7120L

 

 

相较于 WGBSEM-Seq 在更低的测序深度情况下能检测到更多的 CpG 位点。采用 Covaris S2 仪器将 10 ng50 ng 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 60002 X 100 bases)测序,使用 bwa-meth 0.2.2 将测序数据与 hg38 进行比对。通过分析 3.24 亿双端数据得到 EM-Seq WGBS 文库的 CpG 位点覆盖度。

图中显示了 EM-Seq WGBS 两种方法在不同起始量,至少 1X 8X 测序深度下检测到的独有和共有的 CpG 位点。EM-Seq 在至少 1X 测序深度下比 WGBS 多检测到 20% 以上的 CpG 位点。而在至少 8X 测序深度下,CpG 位点覆盖度差异增加至 2 倍。

 

NEBNext®-Oxford Nanopore Technologies® 连接测序配套试剂 货 号 #E7180LNEB酶试剂 New England Biolabs

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产品资料 – 用于二代测序的 NEBNext® 试剂 – 适用于 Oxford Nanopore Technologies 测序平台

NEBNext®-Oxford Nanopore Technologies® 连接测序配套试剂                              收藏

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相关产品

NEBNext FFPE DNA 修复混合液

NEBNext Ultra II 末端修复/加 dA 尾模块

NEBNext 快速连接模块

概述

 NEBNext®-Oxford Nanopore Technologies® 连接测序配套试剂(E7180)包含以下三个 Oxford Nanopore Technologies 连接测序文库制备推荐模块:NEBNext FFPE DNA 修复混合液(M6630)、NEBNext Ultra II 末端修复/dA 尾模块(E7546)和 NEBNext 快速连接模块(E6056)。现在您可更方便地通过同一个货号 E7180 订购以上所有模块,并且该产品已为 Oxford Nanopore Technologies 连接测序试剂盒(SQK-LSK109)优化了体积。

产品特点

 为连接测序试剂盒(SQK-LSK109)进行了组份体积的优化

更简化的订购和库存管理

适用于所有 Nanopore 测序仪:Minion®Gridion®Promethion®Floungle®

杜绝浪费——没有多余的缓冲液或过量的试剂

 该模块包含了以下试剂,并已为 Oxford Nanopore Technologies 连接测序试剂盒(SQK-LSK109)优化了体积:

NEBNext® FFPE DNA 修复混合液(0.048 ml

NEBNext® FFPE DNA 修复缓冲液(0.084 ml

NEBNext® Ultra™ II 末端修复酶混合液(0.072 ml

NEBNext® Ultra™ II 末端修复反应缓冲液(0.084 ml

快速 T4 连接酶0.024 ml

 使用这些试剂时,请遵循 Oxford Nanopore Technologies 相应设备连接测序试剂盒(SQK-LSK109)的操作手册。