SMARTer Apollo系统专用耗材酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

SMARTer Apollo系统专用耗材
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	640088	Apollo^™ 1.1 mL MiniTubes	960 tubes	询价
Clontech	640089	Apollo^™ 96 Tip Rack	Each	询价
Clontech	640086	Apollo^™ Caps for 0.2 ml PCR 8-Tube Strips, Clear	125 caps	询价
Clontech	640084	Apollo^™ Filter Tips	5 racks	询价
Clontech	640085	Apollo^™ Piercing Tips	1000 tips	询价
Clontech	640087	Apollo^™ Reservoirs	100 reservoirs	询价
Clontech	640082	SMARTer^™ Apollo^™ 0.2 ml PCR 8-Tube Strips, Clear	125 strips	询价
Clontech	640083	SMARTer^™ Apollo^™ Microtiter Plates	25 plates	询价

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SMARTer Apollo系统相关耗材


■ 产品说明
	我们提供多种SMARTer Apollo系统相关耗材制品，包括储液槽，离心管，管盖，平板，吸头，耗材支架。相关耗材和SMARTer Apollo试剂、程序脚本配合使用，为自动化DNA-seq，RNA-seq，ChIP-seq应用提供完整、易行、一致性良好的文库制备解决方案。

■ 产品图片

Apollo^™ 1.1 ml MiniTubes	Apollo^™ 96 Tip Rack


Apollo^™ Caps for 0.2 ml PCR 8-Tube Strips, Clear	Apollo^™ Filter Tips


Apollo^™ Piercing Tips	Apollo^™ Reservoirs


SMARTer^™ Apollo^™ 0.2 ml PCR 8-Tube Strips, Clear	SMARTer^™ Apollo^™ Microtiter Plates



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页面更新：2019-11-06 14:38:31

自动化高通量的单细胞全长转录组分析酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

自动化高通量的单细胞全长转录组分析
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	640219	SMART-Seq^® ICELL8^® Application Kit – 1 Chip	1 Rxn	询价
Clontech	640183	ICELL8^® 250v Chip	1 Chip	询价
Clontech	640202	SMART-Seq^® ICELL8^® Reagent Kit	1 Chip	询价
Clontech	640203	SMART-Seq^® ICELL8^® Reagent Kit	3 Chips	询价
Clontech	640204	SMART-Seq^® ICELL8^® Reagent Kit	5 Chips	询价
Clontech	640205	SMART-Seq^® ICELL8^® Indexing Primer Set – A	1 Chip	询价
Clontech	640218	SMART-Seq^® ICELL8^® Indexing Primer Set – B	1 Chip	询价
Clontech	640212	ICELL8^® Collection Kit – L	1 Pkg	询价
Clontech	640206	ICELL8^® Loading Kit – B	1 Pkg	询价
Clontech	640048	ICELL8^® Collection Kit	1 Pkg	询价
Clontech	640192	ICELL8^® 384-Well Source Plate and Seal (5/pack)	Each	询价

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SMART-Seq技术助力ICELL8 cx系统单细胞全长转录组分析方案

全长序列覆盖可以实现对整个转录的差异表达分析，并且可以对基因融合、剪接体这类生物标志物进行检测。高灵敏度的SMART-Seq Pro可以胜任以上分析需求。
SMART-Seq Pro Application Kit将SMART-Seq试剂与ICELL8 cx Single-Cell System（Cat No. 640188）相结合，并整合了生物信息学工具，提供一套端到端的单细胞全长转录组分析流程，一次实验可以对1,200~1,500个分离的单细胞进行高效的全长转录组分析。
通过ICELL8 cx系统将细胞分注到ICELL8 350v Chip（Cat No. 640019）空白微孔芯片中。使用ICELL8 cx CellSelect Software鉴定出含单个细胞的微孔，文库构建试剂只被分注到这些选中的微孔中。经过一系列分注和扩增步骤后，获得无偏倚的全长cDNA，并通过Illumina Bead-Linked Transposome（BLT）完成酶切片段化。在这一扩展性的工作流程中，cDNA扩增阶段引入了Illumina特异性接头序列，生成的文库已连接index接头，可直接用于Illumina测序平台。测序过程结束后，获得的测序数据可直接导入Cogent NGS软件工具进行生物信息学分析，解释测序结果。

NOTE：旧版本SMART-Seq Application Kit（Cat No. 640222）依然可以购买。

更多孔板测序应用，请参见 单细胞RNA-Seq / DNA-Seq

■ 概述

· 端到端的解决方案：从文库制备到测序数据分析工具
· 覆盖全长mRNA：捕获转录组中“深藏”的关键生物标志物，如基因融合、剪接异构体
· 高通量单细胞分析：可以平行地从＞1,000个单细胞中生成测序数据
· 样品配置灵活：一次实验最多可对八种细胞样品进行分析
· 减少样品操作：减小数据波动，构建测序文库前自动鉴定并分选出感兴趣的细胞，仅对这些细胞进行试剂分注
· Illumina平台测序文库：制备的测序文库适用于Illumina全系平台

■应用

用于Illumina平台上高通量全长单细胞转录组测序文库制备

图1. SMART-Seq Pro和Smart-seq2在PBMCs中基因检测结果比较

Technote：
点击图片查看

页面更新：2022-09-02 14:20:28

自动化高通量的单细胞人T细胞受体分析酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

自动化高通量的单细胞人T细胞受体分析
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	640178	ICELL8^® TCR Chip	1 Chip	询价
Clontech	640179	ICELL8^® Human TCR a/b Profiling – Indexing Primer Set	1 Chip	询价
Clontech	640180	ICELL8^® Human TCR a/b Profiling – Indexing Primer Set	5 Chips	询价
Clontech	640181	ICELL8^® Human TCR a/b Profiling – Indexing Primer Set	10 Chips	询价
Clontech	640182	ICELL8^® Human TCR a/b Profiling Reagent Kit	Each	询价
Clontech	640048	ICELL8^® Collection Kit	1 Pkg	询价
Clontech	640109	ICELL8^® Loading Kit	1 Pkg	询价
Clontech	640192	ICELL8^® 384-Well Source Plate and Seal (5/pack)	Each	询价

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高通量地阐明单细胞中T细胞受体Alpha-Beta链多样性

· 灵敏性更高：基于RACE技术保证低丰度TCR变体的检出
· 特异性更强：获得全长reads，目的reads占比高，更正确的配对信息
· 5’端捕获测序差异表达分析：通过比对5’末端信息，产生所有转录本差异表达数据
· 灵活、高通量的单细胞分析：单次实验同时分析8个样品，生成上千单细胞的测序数据

■ 应用领域

· 人单细胞TCR库分析（TCRα和TCRβ克隆型）
· 5’端差异表达分析

■ 产品说明

Takara Bio高通量TCR免疫组库解决方案应用SMART技术(Switching Mechanism at 5’End of RNA Template)和基于5’RACE的方法，用于捕获由ICELL8 Single-Cell Sytem分选得到的上千“活的单细胞”的TCR转录本完整V(D)J可变区域。产生的文库可同时提供α链和β链的多样性信息。
实验流程中，cDNA扩增阶段整合了Illumina特异的接头序列，产生的文库带有index接头，可直接用于Illumina平台测序。Takara Bio高通量TCR免疫组库解决方案也可以同时支持5’末端差异表达分析。
在ICELL8单细胞分选系统中，与单个T细胞一起被分注到TCR芯片（Code No. 640178）上的还有阳性对照和阴性对照。每个TCR芯片含有5,184个纳升级微孔，预制了1,728种Barcode，每个Barcode在芯片上被预制3次。使用CellSelect软件鉴定出具有“活的单细胞”微孔后，SMART RT-PCR试剂将被分注到含“活单细胞”的微孔中，用于后续分析。连接了Barcode序列的cDNA继续在微孔芯片上完成PCR扩增。接下来，从芯片中将连接好Barcode序列的扩增产物集中收集，并进行纯化。纯化后的cDNA作为第一轮TCR特异性PCR的模板，而第一轮TCR特异性PCR的产物作为第二轮TCR特异性PCR的模板，并整合Illumina index序列引物。

■ 产品组分

完整的工作流程需要下列Takara Bio产品。请参考User Manual得到一份完整的试剂耗材清单：

用于ICELL8 Single-Cell System

· ICELL8 TCR Chip (Code No. 640178)
· ICELL8 Human TCR a/b Profiling Reagent Kit (Code No. 640182)
· ICELL8 Human TCR a/b Profiling Indexing Primer Set (Code No. 640179, 640180, 640181)*
· ICELL8 Collection Kit (Code No. 640048)
· ICELL8 Loading Kit (Code No. 640109)

User Manual：ICELL8^® Human TCR a/b Profiling User Manual

*NOTE：Code No. 640179包含的Primer量足够1张芯片使用，若实验中需要使用多张芯片，请购买合适的indexing primer set。640180适用于5张芯片的实验，640181适用于10张芯片的实验。

图1 ICELL8 Human TCR a/b Profiling技术原理流程图

图2 ICELL8 Human TCR a/b Profiling实验流程图

■ 参考文献

Litjens, Nicolle H. R., et al. Validation of a combined transcriptome and T cell receptor Alpha/Beta (TRA/TRB) repertoire assay at the single cell level for paucicellular samples. Front. Immunol., 11, (2020)

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页面更新：2020-11-18 11:52:06

自动化高通量的单细胞差异表达分析酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

自动化高通量的单细胞差异表达分析
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	640164	ICELL8^® Chip and Reagent 3’DE Kit	1 Rxn	询价
Clontech	640165	ICELL8^® Chip and Reagent 3’DE Kit	3 Rxns	询价
Clontech	640166	ICELL8^® Chip and Reagent 3’DE Kit	5 Rxns	询价
Clontech	640167	ICELL8^® 3’DE Reagent Kit	1 Rxn	询价
Clontech	640143	ICELL8^® 3’DE Chip	1 Chip	询价
Clontech	640048	ICELL8^® Collection Kit	1 Pkg	询价
Clontech	640109	ICELL8^® Loading Kit	1 Pkg	询价
Clontech	640005	ICELL8^® 3’DE for UMI Reagent Kit	1 Rxn	询价
Clontech	640192	ICELL8^® 384-Well Source Plate and Seal (5/pack)	Each	询价

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高通量、高品质、更经济的单细胞3’端转录组分析解决方案

· 高通量单细胞分析：同时生成上千单细胞测序数据 · 样品灵活性高：一次实验可同时对8个不同样品进行单细胞分析 · mRNA 3’端捕获测序：mRNA 3’端捕获测序差异表达分析所需reads数更少 · 减少样品处理操作：自动完成文库构建前的细胞分离、挑选及混样，偏差更小 · 兼容illumina平台：构建的文库支持illumina平台测序

■ 产品说明
通过结合Takara Bio单细胞RNA-Seq文库构建的技术优势及ICELL8 cx Single-Cell System（Code No. 640188）单细胞分选的优良性能，ICELL8 3’DE Reagent Kit 实验流程能够一次制备最多八个不同样品的I llumina测序文库，可高通量地分析单细胞基因表达差异。样品细胞经过染色、稀释，使用ICELL8 cx单细胞分选系统将其分注到微孔芯片ICELL8 cx 3’DE Chip（Code No. 640199）中。微孔芯片表面排布5,184个纳升微孔，并预先固相化了Barcodes。通过单细胞分选系统的成像功能和配套的CellSelect软件，含有活单细胞的微孔将被挑选出来，并添加RT-PCR试剂，在芯片中完成cDNA合成与扩增。从芯片中将DNA产物混合收集，使用基于转座酶的方法富集mRNA 3’ 端来源的cDNA，随后通过PCR扩增整合入Illumina index序列。通过每个微孔特异的Barcode序列，能从最终的文库测序数据中回溯每个活的单细胞来源的数据，并可基于mRNA 3’ 端计数，进行差异基因表达分析。配合ICELL8 cx单细胞分选系统，ICELL8 3’DE Reagent Kit为高通量单细胞差异表达分析提供了高效、经济的解决方案，一次实验即可从上千个活的单细胞获得高质量3’ 端测序数据。

■ 产品组分
完整的工作流程需要下列Takara Bio产品。同时，请参考对应的User Manual得到一份完整的试剂耗材清单：
用于ICELL8 cx Single-Cell System
· ICELL8 cx 3’DE Chip (Code No. 640199) · ICELL8 3’DE Reagent Kit（Code No. 640167) · ICELL8 Collection Kit-L (Code No. 640212) · ICELL8 cx Loading Kit (Code No. 640197) · ICELL8 384-Well Source Plate and Seal (5/pack) (Code No. 640192)
User Manual：ICELL8^® cx 3’DE User Manual


图1 ICELL8 3’DE Reagent Kit工作流程


图2 选取iPS细胞分化至心肌细胞过程中的四个时间点（Day1/3/9/21），用 ICELL8 Single-Cell System进行单细胞高通量3’末端转录组分析，共获得约1,000个活的单细胞，平均每个细胞超过120,000 reads，测得1,200个基因（最大为750,000 reads，测得4,500个基因）；tSNE分析结果可以看出不同分化阶段的细胞存在明显的基因表达差异。


图3 细胞特异性基因表达变化随着分化的进行，iPS细胞特异性基因的表达数量减少，而心肌细胞特异性基因的表达数量增加。

Technote：点击图片查看

参考文献
1. Ren, Z. et al. Single-Cell Reconstruction of Progression Trajectory Reveals Intervention Principles in Pathological Cardiac Hypertrophy. Circulation, 141, 1704–1719 (2020) 2. Wang, L. et al. Single-cell reconstruction of the adult human heart during heart failure and recovery reveals the cellular landscape underlying cardiac function. Nat. Cell Biol. 22, 108–119 (2020) 3. Krieger, T. G., et al. Modeling Glioblastoma Invasion Using Human Brain Organoids and Single-Cell Transcriptomics. Neuro-Oncology, 22, 1138–1149 (2020) 4. Yekelchyk, M., Guenther, S., Preussner, J. & Braun, T. Mono- and multi-nucleated ventricular cardiomyocytes constitute a transcriptionally homogenous cell population. Basic Res. Cardiol. 114, 36 (2019)

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页面更新：2022-09-02 14:15:21

PicoPLEX WGA Kit酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

PicoPLEX WGA Kit
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	R30050	PicoPLEX WGA Kit	50 Rxns	询价
Clontech	R300644	PicoPLEX WGA Kit	500 Rxns	询价

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单细胞全基因组扩增

PicoPLEX^® WGA Kit

· 可以单细胞（或<15 pg DNA）起始获得可重复结果
· 出色的等位基因重复性
· 易于使用和自动化
· 清晰的实验结果，不论微阵列还是PCR

■ 产品说明：

从单细胞中扩增DNA构建高重复性的文库现在成为可能！PicoPLEX WGA kit采用专利技术（U.S. Patents 8,206,913），设计、优化用于从单细胞中扩增单拷贝基因组DNA。便捷的单管操作流程减少了手动操作的失误，缩短了获得结果的时间并降低背景。PicoPLEX WGA Kit同样也可用于6 pg至50 pg的纯化gDNA，并兼容微阵列比较基因组杂交（array CGH）分析及PCR。
PicoPLEX WGA Kit被IVF行业供应商如BlueGnome信赖并用于胚胎植入前遗传学筛查和诊断(PGS/PGD)。

图1. PicoPLEX WGA Kit单管操作流程。

图2. PicoPLEX WGA Kit 技术概要。细胞裂解，特殊随机引物DNA选择性预扩展，终轮PCR扩增。

图3. 单细胞扩增重复性分析。流式细胞仪分选肿瘤细胞，采用PicoPLEX WGA Kit 扩增。每个细胞（蓝色曲线）扩增比率相同，并且可获得相同的预期产量。不含细胞的样品（绿色曲线；空白模板对照）显示非常低的背景。

图4. CNV（拷贝数变异）分析。利用单卵裂球活体组织检查样品采用PicoPLEX WGA Kit扩増标记后，与BlueGnome^® 24sure^® arrays杂交（Genesis Genetics Institute），结果清晰地显示了CNV。2011年ESHRE （欧洲人类生殖与胚胎学会）的临床实验证明了采用PicoPLEX 技术进行人类染色体核型分析的准确性。

■ 产品组成

· Cell Extraction Buffer
· Extraction Enzyme Dilution Buffer
· Cell Extraction Enzyme
· Pre-Amp Buffer
· Pre-Amp Enzyme
· Amplification Buffer
· Amplification Enzyme
· Nuclease-Free water

■ 保存

－20℃

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页面更新：2022-03-08 16:18:45

PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	R300718	PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3	24 Rxns	￥5,518
Clontech	R300722	PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3	96 Rxns	￥19,606
Clontech	R300723	PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3	480 Rxns	￥83,328

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PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3

· 单细胞（或＜15 pg DNA）起始，可获得可重复的结果
· 卓越的等位基因再现性
· 易于使用和自动化
· 应用广泛，可以用于微阵列，PCR等

PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3 (PicoPLEX WGA v3)可以从单细胞扩增DNA，获得高度可重复的文库。细胞裂解和预扩增后，进行低背景的PCR扩增，并在3小时内获得微克级产物。
除了延续之前PicoPLEX WGA Kit可进行高度可重复的拷贝数变异（CNV）分析外，该试剂盒通过使用高保真酶，尽可能减少扩增误差，并能检测单核苷酸变异（SNV）。

图1. PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3技术

表1 .使用PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3进行高质量单核苷酸变异（SNV）检测

以单细胞 (1cell) 和5个细胞 (5 cells) 的GM12878细胞系 (Coriell研究所) 起始 (一式两份)，分别使用PicoPLEX WGA v3,A公司试剂盒和B公司试剂盒，以及bulk gDNA对照制备全基因组扩增产物，进行SNV检测的比较。其中B公司试剂盒虽然制备了足够的扩增产物，但只有5 cells样本中一个包含足够的扩增子进行测序，而其他样本无可用数据进行测序。根据Genome In a Bottle (GIB) 和hg19 (human Genome assembly GRCh37, Ensembl) 数据库的交叉分析，预计GM12879细胞系总共存在78个SNVs。由于扩增子的设计，2×75 bp的读取长度很短，78个SNVs中的4个未能检测到。因此，检测的SNV总数减少到74个。使用VarDict软件，以≥10reads (10X coverage) 和等位基因频率≥20％为基准从BAM文件分析SNV。与其他两个公司试剂盒相比，PicoPLEX WGA v3具有更高的call rates和更低的等位基因丢失率。

（数据来源于Takara Bio USA, Inc.）

图2. 基于PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的CNV检测

以来自不同细胞系(GM22601、GM05067和GM12878)的单细胞起始，使用PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3扩增基因组。之后取1ng的扩增产物，使用Illumina Nextera XT Kit制备文库，并在Illumina MiSeq（PE 75）进行测序。对Fastq文件去除接头序列信息后，与human genome assembly GRCh37进行比对。只分析常染色体。对于这两个panels，校准归一化至100万reads，使用bedtools 2.25.0计算每1 Mb的 bin的reads数。使用Integrative Genomics Viewer (IGV)绘制bin counts的log2 ratio (Sample/Reference)。PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3还显示了可以高品质的进行染色体异倍性分析。

图3. PicoPLEX Single Cell WGA Kit v3的全基因组覆盖范围的重现性高

以GM12878的单细胞样本起始（一式两份），分别使用PicoPLEX WGA v3，A公司试剂盒和B公司试剂盒扩增基因组。之后取1ng的扩增产物，使用Illumina Nextera XT Kit制备文库，并在MiSeq（PE 75）进行测序。然后与human genome assembly GRCh37进行比对，归一化至1M reads (0.5M paired-end reads)后，使用bedtools 2.25.0计算每个1 Mb的bin的reads数。对这两个单细胞文库的每个窗口的total read进行绘制，计算Pearson和Spearman相关性并在每个图中标明。

Panel A. 包含异常值的样本。*由于不同技术存在不同的偏差，没有排除相关点，所以图表的比例不同。
Panel B. 排除异常值的样本。与A公司和B公司试剂盒相比，PicoPLEX WGA v3具有更高的重现性和覆盖度。

（数据来源于Takara Bio USA, Inc.）

Technote：

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PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	R300669	PicoPLEX^® Gold Single Cell DNA-Seq Kit	24 Rxns	￥9,976
Clontech	R300670	PicoPLEX^® Gold Single Cell DNA-Seq Kit	96 Rxns	￥35,035
Clontech	R300698	PicoPLEX^® Gold Single Cell DNA-Seq Kit	384 Rxns	￥103,368

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单细胞起始的DNA测序文库构建

PicoPLEX^® Gold Single Cell DNA-Seq Kit

· 高重现性和准确性：可用于CNV、SNV和非整倍体检测
· 在SNV和CNV检测方面优于MDA技术
· 三小时的工作流程，手动操作时间不到30分钟
· 均匀的高覆盖率，低的等位基因插入率和脱扣率

■ 应用：

适用于以下细胞类型的文库制备：

· 癌症研究：循环肿瘤细胞（CTC）,激光捕获显微切割（LCM）细胞或DNA，
以及细针抽吸（FNA）细胞；
· 生殖健康研究：胚胎细胞和循环胎儿细胞；
· 发育生物学：胚胎细胞，干细胞和稀有细胞；
· 宏基因组学和微生物学：微生物细胞，微生物组和环境样品。

■ 产品说明：

PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit

PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit (PicoPLEX Gold) 是一种旨在从单细胞中生成高质量的DNA文库，以便在Illumina平台进行测序的试剂盒。该试剂盒基于PicoPLEX专利技术（U.S. Patents 8,206,913），优化用于检测拷贝数变异 (CNVs)、单核苷酸变异 (SNVs)、插入缺失 (indels) 和结构变异 (SV)。PicoPLEX Gold kit在SNV检测中表现出比MDA技术更好的性能。
PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit不包含index。兼容的 Index如下所述，需要单独购买。
PicoPLEX WGA是一种在全球被广泛用于检测单细胞中CNV的全基因组扩增（WGA）技术。最初，PicoPLEX技术主要用于高再现性的检测非整倍体异倍性和CNV。为了满足准确检测SNV的需求，对PicoPLEX WGA技术中的酶、引物和protocols进行了进一步优化，不仅提升了扩增的覆盖度、一致性、准确性，同时提高了CNV、SNV、Indel和其他SV的分辨率，并且保持了高重现性。
PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit可以固定细胞或非固定细胞起始，只需简单的4步操作流程，即可在3小时内完成Illumina NGS文库的构建，且手动操作时间非常短。

DNA HT dual index kits

DNA HT dual index kits是与 ThruPLEX或 PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用，用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含Illumina Nextera^® XT v2 index序列对应的index引物，最多可提供384种不同的双端index，用于样本混合测序时的区分。其中index引物预先分装在4个的不同条形码标记的index微孔板中，每个微孔板可提供不同的96种index组合 (Code No.R400660-R400663)，index微孔板（96N Sets A-D）的每个孔提供的量足够进行一次测序反应；另一种是一套中有24个单独的反应管，每个反应管中包含不同的双端index组合（Code No.R400664），且每个反应管（24N）提供的量足够进行两次测序反应。

DNA unique dual index kits

DNA unique dual index kits是与 ThruPLEX或 PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用，用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含“IDT for Illumina UD”对应的index引物，最多可提供96种不同双端index，用于样本混合测序时的区分。index引物预先分装在不同的4组各24个单独的管中，其中每组可提供24种不同index引物组合（Code No.R400665-R400668）。每个index引物管（24U Sets A-D）提供的量足够进行两次测序反应。

DNA single index kits

DNA single index kits是与 ThruPLEX或 PicoPLEX文库制备试剂盒搭配使用，用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含与“TruSeq LT set A”序列对应的index引物，可提供24种单端index，用于样本混合测序时的区分。index引物预先分装在不同的2组各12个单独的管中，其中每组可提供12种不同index引物组合（Code No.R400695和R400697）。每个index引物管（12U Sets A-B）提供的量足够进行8次测序反应。

图1. PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit技术。
PicoPLEX Gold的技术概要。通过step1裂解细胞获得gDNA，通过随机引物进行预扩增 (step 2)，然后进行指数扩增得到测序文库（step 4）。

图2. PicoPLEX Gold的主要特点：高覆盖度，高均匀性，和高重现性 (与A产品技术相比)。
Panel A. 图中显示在不同深度的测序中覆盖的碱基数 (～35M read pairs，PE 2 × 150 bp) 。PicoPLEX Gold在较低深度的覆盖度与A产品 (MDA) 相似，在较高深度的覆盖度高于A产品（MDA）。
Panel B. 以gDNA样本 (NA12878) 和单细胞样本 (GM12878) 起始，使用PicoPLEX Gold和A产品进行全基因组扩增。相比较于MDA，PicoPLEX Gold显示出更均匀的覆盖度。
Panel C. 评估覆盖度的重现性。与A产品 (右) 相比，PicoPLEX Gold (左) 的在两个单细胞群之间的一致性明显更好。

图3. 使用PicoPLEX Gold进行高质量单核苷酸变异（SNV）检测。
Panel A. 以单细胞（1c），5个细胞（5c）或15 pg的 NA12878 gDNA起始，比较A产品（MDA），PicoPLEX Gold（PP Gold）和 PicoPLEX WGA（PP WGA）这3个试剂盒之间的SNV检测率。其中1个和5个细胞的测序深度为35M read pairs， gDNA样品深度为40M read pairs。PicoPLEX Gold（蓝色）有高的保真度和覆盖度，与A产品（灰色）和PicoPLEX WGA（紫色）相比，可以高质量的检测更多的SNV（2-9倍），具有明显的优势。
Panel B. PicoPLEX Gold（蓝色）的B等位基因频率的对称分布，以0.5为中心，展示两个等位基因的平衡情况。与A产品（MDA）相比，PicoPLEX具有更好的等位基因平衡（灰色）。
Panel C. PicoPLEX Gold的无偏扩增, 在测试的所有单细胞文库制备的技术中，表现出最低的等位基因脱扣率（假阴性）。
Panel D. PicoPLEX Gold试剂盒中的聚合酶具有高保真度（蓝色），使得等位基因插入率与A产品（灰色）相当，且显著低于PicoPLEX WGA（紫色）。

Technote：

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SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	R400750	SMART-Seq^® Single Cell PLUS Kit	48 Rxns	￥47,828
Clontech	R400751	SMART-Seq^® Single Cell PLUS Kit	96 Rxns	￥85,494
Clontech	R400744	Unique Dual Index Kit – 48U	48 Rxns	询价
Clontech	R400745	Unique Dual Index Kit – 96U	96 Rxns	询价
Clontech	634470	SMART-Seq Single Cell Kit	12 Rxns	￥13,341
Clontech	634471	SMART-Seq Single Cell Kit	48 Rxns	￥37,759
Clontech	634472	SMART-Seq Single Cell Kit	96 Rxns	￥65,697

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SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell Plus Kit：更胜一筹的单细胞mRNA全长分析

· 简便，基于Plate的工作流程 - 可直接以FACS或其他方法分选的单细胞起始
· 单管操作流程 - SMART-Seq Single Cell PLUS Kit包含完整的cDNA合成和文库构建流程，分别在单管中进行，减少样品损失与混淆，降低手动操作误差
· 灵敏度高和一致性好 - 非常适用于单细胞（尤其是RNA含量非常低的细胞和细胞核）RNA-Seq的研究，可检测更多基因
· 可靠的全长cDNA分析 - 性能优于许多现有的单细胞全长cDNA合成方法，例如Smart-seq2
· 增强的测序性能 - SMART-Seq Single Cell PLUS Kit整合双端特殊index（UDI），即便多个文库pool后用高通量型Illumina测序仪（如Novaseq）分析，也能得到正确结果
· 高度灵活的工作流程 - 可与自动化设备兼容
· 更高的文库产量 - 更便于使用高通量型Illumina测序仪分析（如Novaseq），或保存剩余的文库用于多次测序

■ 产品说明

SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc) 和SMART-Seq Single Cell PLUS Kit (SSsc PLUS) 是Takara科学家专门研发推出的两款具有高灵敏度和高可再现性的试剂盒，适用于单细胞和单个细胞核的RNA-Seq分析。试剂盒采用oligo（dT）引物，可从一些RNA含量非常低的单细胞（如PBMC, T细胞，B细胞）直接起始，并完成全长cDNA的捕获。

SMART-Seq Single Cell Kit是基于经典的SMART技术优化改良而来的单细胞cDNA合成试剂盒，可以提供全长转录本的信息，支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等广受科研人员关注的研究内容，具有更高的灵敏度和再现性。此外，该试剂盒还能提供均一的gene body覆盖度，高GC含量转录本也能得到正确分析。这些改进使得SSsc更适合单细胞分析，能得到更多有效reads、更高的基因检测数，对珍贵样本的理解更透彻！这些特点使SSsc远远超过许多现有的单细胞全长cDNA合成方法，例如SMART-Seq2！

SMART-Seq Single Cell PLUS Kit在包含核心的cDNA合成试剂基础上，同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术（U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823）及单次使用的双端特殊index（UDI），提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶，以实现对合成cDNA的片段化，接着利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库。在建库阶段，单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库！

■ SSsc：更胜一筹的单细胞全长转录组分析！

SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit

The SMART-Seq Single Cell Kit outperforms Smart-seq2

图1. 与Smart-seq2法的比较

Takara科学家以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库，分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc,18个重复)和Smart-seq2法（Smart-seq2，20个重复）合成cDNA（均进行19个PCR循环扩增），所有样本都均一化至1.75M paired-end reads，然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。

Panel A 根据cDNA的制备方法不同，结果也不同。相比而言，Smart-seq2结果中比对到线粒体基因组的比率较高，而检测到基因鉴别的reads数相对较少。

Panel B SMART-Seq Single Cell Kit能检测到比Smart-seq2更多的基因。

■ SSsc PLUS Kit：不只是一个Kit，更是完整且更胜一筹的单细胞RNA-Seq建库体验！

为了使单细胞cDNA合成、文库构建实验“一步”到位，我们全新推出了SSsc PLUS Kit，从此您无需再单独购买建库模块，也不用“忍受”不同厂家不同步的供货周期。

从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发，构建更高品质Illumina文库

Takara科学家以10 pg小鼠脑total RNA起始，采用SMART-Seq Single Cell Kit完成cDNA合成。随后分别采用SSsc Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库，并比较性能差异。

从测试数据中可以看出，SSsc PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍，而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪，如Novaseq。

两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序，并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。相较于A公司文库，SSsc PLUS文库能检出更多的基因，从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息！

比较数据来源于Takara Bio USA, Inc.

SSsc点击图片下载

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更多实验数据：

SSsc Kit

SSsc PLUS Kit

延伸阅读：

单细胞NGS解决方案

页面更新：2022-09-02 11:37:45

SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	R400752	SMART-Seq^® v4 PLUS Kit	48 Rxns	￥47,920
Clontech	R400753	SMART-Seq^® v4 PLUS Kit	96 Rxns	￥86,457
Clontech	R400744	Unique Dual Index Kit – 48U	48 Rxns	询价
Clontech	R400745	Unique Dual Index Kit – 96U	96 Rxns	询价
Clontech	634888	SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing	12 Rxns	￥13,966
Clontech	634889	SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing	24 Rxns	￥23,654
Clontech	634890	SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing	48 Rxns	￥37,852
Clontech	634891	SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing	96 Rxns	￥66,839
Clontech	634892	SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing	192 Rxns	￥116,774
Clontech	634893	SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing	480 Rxns	￥232,084

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SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 Plus Kit：性能卓越的Ultra low mRNA全长分析

· 高灵敏度 - 可以从10 pg总RNA起始（起始量：1-1000个细胞或10 pg-10 ng总RNA）
· 高质量的RNA-Seq数据 - 保留全长基因信息，低rRNA比率，高基因检出数，有效扩增GC-rich转录本
· 单管操作流程 - SMART-Seq v4 PLUS Kit包含完整的cDNA合成和文库构建流程，分别在单管中进行，减少样品损失与混淆，降低手动操作误差
·增强的测序性能 - SMART-Seq v4 PLUS Kit整合双端特殊index（UDI），即便多个文库pool后用高通量型Illumina测序仪（如Novaseq）分析，也能得到正确结果
·更高的文库产量 - 更便于使用高通量型Illumina测序仪（如Novaseq）测序，或保存剩余的文库用于多次测序

■ 产品说明

SMART-Seq v4 Kit（SSv4）和SMART-Seq v4 PLUS Kit是第4代SMARTer Ultra low系统，能正确分析低至10 pg的Ultra low RNA，具有高灵敏度、高再现性的特点。
SMART-Seq v4 Kit是基于经典的SMART技术优化改良而来的，用于Ultra low RNA或少量细胞cDNA合成的试剂盒，提供全长转录本的信息，支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等广受科研人员关注的内容，具有更高的灵敏度和再现性。SMART-Seq v4的Oligo中整合锁核酸（Locked Nucleic Acid, LNA）技术，提升了SSv4模板转换效率，能获得更高的再现性、更均一的gene body覆盖度，高GC含量转录本也能得到正确分析。
SMART-Seq v4 PLUS Kit在包含核心的cDNA合成试剂基础上，同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术（U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823）及单次使用的双端特殊index（UDI），提供完整的Ultra low RNA或少量细胞由cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶，以实现对合成cDNA的片段化，接着利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库。在建库阶段，单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库！

■ SSv4 Kit：更受客户认可的经典技术！

SMART-Seq v4 Kit & SMART-Seq v4 PLUS Kit

图1. SMART-Seq v4 模板转换机制

表1. 1、100、1000个Hela细胞主要mRNA-Seq数据 (Illumina^® MiSeq^® platform)

表2. 10 pg-10 ng的人脑总RNA的mRNA-Seq (Illumina^® MiSeq^® platform)

■ SSv4 PLUS Kit：不只是一个Kit，更是完整的Ultra low RNA-Seq建库体验

为了使Ultra low RNA或少量细胞cDNA合成、文库构建实验“一步”到位，我们全新推出了SSv4 PLUS Kit，从此您无需再单独购买建库模块，也不用“忍受”不同厂家不同步的供货周期。

从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发，构建更高品质Illumina文库

Takara科学家从10 pg小鼠脑total RNA起始，采用SMART-Seq v4 Kit完成cDNA合成。随后分别使用SSv4 Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库，并比较性能差异。

比较数据来源于Takara Bio USA, Inc.

从测试数据中可以看出，SSv4 PLUS Kit所建文库的产量高于A公司Kit产量，而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪，如Novaseq。

两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序，并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。SSv4 PLUS文库能比A公司文库检出更多基因，从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息！

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更多实验数据：

SSv4 Kit

SS v4 Plus Kit

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单细胞NGS解决方案

页面更新：2022-09-02 11:53:23

Whatman110611Nuclepore径迹蚀刻膜 NUC PC 25MM 2.0um 100/PK

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

【简单介绍】

Whatman给实验者提供了多种材质的滤膜，先进的技术规范使得今天很多的应用都更愿意选择Whatman
产品。滤膜的孔径精确、韧性好，保证了再现性和一致性。Whatman滤膜孔径范围很广，从0.2µm-12µm，并有很多选择的膜过滤容器。
无菌和消毒包装可用于特殊应用中，也有着色网格类型可供选择。

【简单介绍】

【详细说明】

原装进口英国Whatman110611Nuclepore径迹蚀刻膜 NUC PC 25MM 2.0um 100/PK

英国Whatman110611Nuclepore径迹蚀刻膜 NUC PC 25MM 2.0um 100/PK

产品介绍：

Whatman给实验者提供了多种材质的滤膜，先进的技术规范使得今天很多的应用都更愿意选择Whatman
产品。滤膜的孔径精确、韧性好，保证了再现性和一致性。Whatman滤膜孔径范围很广，从0.2μm-12μm，并有很多选择的膜过滤容器。
无菌和消毒包装可用于特殊应用中，也有着色网格类型可供选择。

产品特点：

Nuclepore聚碳酸径迹蚀刻膜由高质量的聚碳酸薄膜制成，具有孔径精确、流速快等特点，并且有着极好的耐化学性和耐热性，这类膜表面光滑而平整，对提取物几乎没有吸附。这种膜还有黑色膜，背景反差大，用于荧光和其它显微镜法。

Track-Etched Polycarbonate and Polyester Membranes

径迹蚀刻聚碳酸酯膜和聚脂膜

Nuclepore Track-Etched Membranes聚碳酸酯膜

Nuclepore聚碳酸酯径迹蚀刻膜是由高品质的聚碳酸酯薄膜制成，具有孔径精确、流速快等特点。并且有着极好的耐化学性和耐热性。这类膜表面光滑而平整，对提取物几乎没有吸附。

特性

不吸附蛋白和提取物，对样品无污染

良好的耐化学性和热稳定性，适用于大多数样品

低灰分、低皮重

膜表面光滑而平整，便于对截留物粒子进行观察

可提供黑色膜，用于荧光和其他纤维镜法，背景反差大

应用

荧光显微镜、生物分析、环境分析、寄生生物学、细胞培养、空气分析、EPA检验、

水体微生物学、燃烧检测。

技术参数-Nuclepore聚碳酸酯膜
产品名	聚碳酸酯
厚度	6-11μm
爆裂强度	>10 psi
净重	0.6-1mg/ cm2
原料比重	1.20g/ cm2
热封范围	230℃-275℃
最高可耐高温	140℃
易燃性	Slow burn
灰度	0.92μg/ cm2
孔率	<15%
计算孔径	0.05-12.0μm
计算孔密度	105-6×108pore/ cm2
表面质地	平滑
透明度	半透明
折射率	1.584-1.625（双折射）
疏水	否
纤维释放	否
高温蒸汽灭菌	121℃

订货信息-Nuclepore聚碳酸酯膜
直径（mm）	孔径（um）	货号	直径（mm）	孔径（um）	货号
13	0.015	110401	25	0.03	110602
13	0.1	110405	25	0.05	110603
13	0.2	110406	25	0.08	110604
13	0.4	110407	25	0.1	110605
13	0.8	110409	25	0.2	110606
13	1	110410	25	0.4	110607
13	3	110412	25	0.6	110608
13	5	110413	25	0.8	110609
13	8	110414	25	1	110610
13	10	110415	25	2	110611
13**	8	150446	25	3	110612
13****	0.8	800195***	25	5	110613

*AOX―适用于AOX（Adsorbable Organic Halogens）分析

**不含PVP疏水 ****Good Coated PC *50片/盒

***AERO **25片/盒

***10片/盒

上海金畔生物科技有限公司

文章号19705563-19705563

SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	R400748	SMART-Seq^® HT PLUS Kit	48 Rxns	￥26,309
Clontech	R400749	SMART-Seq^® HT PLUS Kit	96 Rxns	￥51,365
Clontech	R400744	Unique Dual Index Kit – 48U	48 Rxns	询价
Clontech	R400745	Unique Dual Index Kit – 96U	96 Rxns	询价
Clontech	634455	SMART-Seq^® HT Kit	12 Rxns	￥4,458
Clontech	634456	SMART-Seq^® HT Kit	48 Rxns	￥16,049
Clontech	634436	SMART-Seq^® HT Kit	480 Rxns	￥118,883
Clontech	634437	SMART-Seq^® HT Kit	96 Rxns	￥30,910
Clontech	634438	SMART-Seq^® HT Kit	192 Rxns	￥57,064
Clontech	634439	SMART-Seq^® HT Lysis Components	96 Rxns	￥1,199

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SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT Plus Kit：自动化友好型的单细胞mRNA全长分析

· 自动化友好型 - 兼容自动化工作站，更少的时间分析更多的样本
· 高灵敏度 - 可以从单细胞或10 pg总RNA起始（起始量：1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA）
· 高质量的RNA-Seq数据 - 保留全长基因信息，低rRNA比率，高基因检出数，有效扩增GC-rich转录本
· 单管操作流程 - SMART-Seq HT PLUS Kit包含完整的cDNA合成和文库构建流程，分别在单管中进行，减少样品损失与混淆，降低手动操作误差
· 增强的测序性能 - SMART-Seq HT PLUS Kit整合双端特殊index（UDI），即便多个文库pool后用高通量型illumina测序仪（如Novaseq）分析，也能得到正确结果
· 更高的文库产量 - 更便于使用高通量型illumina测序仪测序（如Novaseq），或保存剩余的文库用于多次测序

■ 产品说明

SMART-Seq HT Kit（SS-HT）和SMART-Seq HT Plus Kit（SS-HT PLUS）均兼容自动化移液工作站，采用oligo(dT)引物，支持1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA起始。
SS-HT试剂盒是从第4代的SMARTer Ultra Low试剂（SMART-Seq v4）发展而来的，具有简化的操作流程，将原有的反转录和PCR扩增步骤整合为一步，且不影响性能。细胞分离或RNA提取后，仅通过一步RT-PCR扩增双链cDNA，然后进行纯化完成操作。cDNA合成可在4小时内完成，整个文库构建方案可在2天内完成。而且，SMART-Seq HT试剂盒具有与SMART-Seq v4试剂盒相同的灵敏度和可重复性。核心的SMART技术，是一种对全转录组研究，以及包括细胞内剪接位点，可变剪接研究的非常强大的工具，且可以检测全长基因。 Oligo（dT）可以从高品质总RNA（RIN> 8）或完整细胞中特异性扩增mRNA。通过采用LNA技术，提升了模板转换的效率与基因检出数等性能。
SS-HT PLUS Kit在包含核心的cDNA合成试剂基础上，同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术（U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727,10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823）及单次使用的双端特殊index（UDI），提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶，以实现对合成cDNA的片段化，接着利用特别的茎环形接头构建高品质illumina文库。在建库阶段，单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库！

■ SS-HT Kit：流程缩短、性能不变！

SMART-Seq HT Kit & SMART-Seq HT PLUS Kit

图1 SMART-Seq HT的技术流程

图2 SMART-Seq v4和SMART-Seq HT工作流程的比较

SMART-Seq HT（右）是由SMART-Seq v4方法（左）经过改进而来的一个手动操作时间更短的高通量工作流程。使用FACS方法获得单细胞，SMART-Seq HT试剂盒只需3个操作步骤即可制备cDNA，而SMART-Seq v4试剂盒需要6步。SMART-Seq HT工作流程的一个重要步骤是一步RT-PCR，即使用一步RT-PCR缓冲液，进行高效的反转录和PCR扩增cDNA的过程。

图3 使用SMART-seq v4 kit和SMART-Seq HT kit从FACS分选的293T细胞中获得的高重复性的基因表达数据

使用SMART-Seq v4试剂盒（SSv4_1-SSv4_12）和SMART-Seq HT试剂盒（ HT_1-HT_9）（上图）从21个293T细胞单细胞制备文库，并对每个细胞获得的基因表达性进行评估。层次聚类热图展示了所有细胞之间的Euclidean distances，并显示从0.74到0.97的Pearson相关性。不仅用相同试剂盒制备的细胞之间可以观察到非常高的相关性，而在两种试剂盒之间的相关性也非常高。这些数据表明，SMART-Seq HT的工作流程与SMART-Seq v4相比，在基因表达分析中没有显著的偏差。

■ SS-HT PLUS Kit：不只是一个Kit，更是完整的单细胞RNA-Seq建库体验！

为了使单细胞cDNA合成、文库构建实验“一步”到位，我们全新推出了SS-HT PLUS Kit。

从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发，构建更高品质illumina文库

Takara科学家从10 pg小鼠脑total RNA起始，采用SMART-Seq HT Kit完成cDNA合成。随后分别使用SS-HT Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库，并比较性能差异。

(比较数据来源于Takara Bio USA, Inc.)

从测试数据中可以看出，SS-HT PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍，而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪，如Novaseq。

两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序，并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。SS-HT PLUS文库能比A公司文库多检出10%的基因，从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息！

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SS-HT Kit

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页面更新：2022-09-02 10:46:54

SMART-Seq Stranded Kit酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

SMART-Seq Stranded Kit
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	634442	SMART-Seq^® Stranded Kit	12 Rxns	￥12,631
Clontech	634443	SMART-Seq^® Stranded Kit	48 Rxns	￥41,939
Clontech	634444	SMART-Seq^® Stranded Kit	96 Rxns	￥55,549

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SMART-Seq^® Stranded Kit

SMART-Seq^®Stranded Kit：以单细胞起始，构建高质量的链特异性RNA-seq文库

· 操作简便：以1–1,000个细胞或10 pg-10 ng的总RNA起始，仅需7h即可完成文库制备；
· 高灵敏度：可以单细胞起始，保留链特异性，最终获得全长总RNA序列信息；
· 高再现性：准确检测包含编码和非编码RNA在内的全部转录组；
· 用途广泛：适用于降解的样本；
· 适用对象：人、小鼠、大鼠。

SMART-Seq^® Stranded Kit能够直接从1-1,000个完整细胞（或10 pg-10 ng总RNA）起始，制备链特异性Illumina测序文库。本试剂采用随机引物法可以制备完整的转录组文库，并适用于部分降解及低品质的RNA。此外，本试剂采用专有的ZapR技术，在文库制备过程中去除核糖体cDNA。

如果是以oligo-dT引物起始对微量高品质的RNA进行cDNA合成时，推荐使用 SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing 或SMART-Seq HT Kit试剂盒。

图1. SMART-Seq Stranded Kit的技术流程

图2. 使用SMART-Seq Stranded Kit制备文库的结构特征

接头序列包含：通过PCR 1反应添加的可以与Illumina流动池结合生成簇的P7、P5序列（P7以淡蓝色表示，P5以红色表示），用于区分单个lane上多个样本的Index序列（Index 1 [i 7] 序列连接在P7端，Index 2 [i 5]连接在P5端）。并且还包括识别测序引物区域的Read 2（紫色）和 Read 1（绿色）。通过Read 1起始得到的原始RNA的反义链序列，Read 2起始获得的是原始RNA的正义链序列。其中，通过Read 2起始时，前3个碱基（XXX）是SMART-Seq Stranded Adapter衍生的序列。因此在双端测序时，需要在mapping前去掉这3个碱基。

表1.不同样本起始量的分析结果

以人脑总RNA 10 pg至10 ng不同量起始，使用SMART-Seq Stranded Kit制备RNA-Seq文库。该表中所显示的数据是三次重复的平均值，且重复之间相关性系数非常高（Pearson/Spearman表示）。即使起始量为10 pg时，也具有非常高的重现性。

图3. 在低起始量时，SMART-Seq Stranded Kit和Pico v2的比较

Panel A.以人脑总RNA (50 pg-10 ng)起始，分别使用SMART- Seq Stranded Kit和SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 -Pico Input Mammalian (Pico v2)制备RNA-Seq文库（均做三次重复）。从测序数据随机抽取250万paired-end reads进行生物学信息分析。

Panel B.比较这两个试剂盒在总RNA以 50 pg起始制备文库的转录表达水平 (见Panel A)， SMART-Seq Stranded Kit (Pearson =0.97)的再现性高于Pico v2 (pearson =0.92)。

图4. 不同起始量样本的高重现性

利用FACS分离出A375细胞，分别以1-1,000个细胞起始使用SMART-Seq Stranded Kit制备测序文库。其中，以5-1,000个细胞起始时，均做两个重复；以单个细胞起始时，做12个重复。为了作比较，同时使用从两种1,000个细胞中纯化的总RNA制备文库。

Panel A.：1-1,000个细胞起始的分析结果；

Panel B.：通过聚类热图展示了Panel A.中所示的所有样本的Euclidea距离，以及Pearson相关系数（范围为0.85至0.99）。其中单细胞样本标记为Cell1-Cell12，其他样本分别标记为a-b。

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页面更新：2020-04-10 11:06:07

SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	634832	SMARTer Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System	Each	￥13,576
Clontech	634833	SMARTer Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System	Each	￥48,984
Clontech	635025	SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for the Fluidigm C1 System, 4 IFCs	Each	￥16,692
Clontech	635026	SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for the Fluidigm C1 System, 10 IFCs	Each	￥33,489

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SMART-Seq v4 Ultra Low RNA Kit for the Fluidigm C1 System
—性能卓越的单细胞转录组分析

· 升级的SMART技术—带有LNA修饰的SMART-Seq v4 oligo 加升级的配方带来更好的性能
   (更高灵敏度，更好重复性，更多的GC-rich基因)
· 文库构建只需2天—cDNA合成约需2h，其次需要在Fluidigm C1平台中运行8小时的
   SMART-Seq v4 script，整个文库构建过程可以在2个工作日内完成
· 新script—支持mRNA Seq IFC 和 Open App IFC，SMART-Seq v4 script可以从
   Fluidigm Script Hub下载

单细胞转录组研究对于细胞群体内每个细胞的基因表达变化研究是非常重要的。Takara Clontech 开发了兼容Fluidigm IFC （integrated fluidic circuit）的强大的单细胞研究工具。高灵敏度的SMARTer技术结合高通量自动化的Fluidigm C1系统，可以对转录组进行深入细致分析。
我们提供两种版本的单细胞mRNA-Seq 试剂，用于Fluidigm C1单细胞自动制备系统。新版本SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for the Fluidigm C1 System沿袭了SMART-Seq v4的优势，结合了SMART技术和LNA修饰，称为"SMARTer-seq^® chemistry"。本试剂超越了发表过的操作流程和以往版本的试剂，利用本试剂可以获得灵敏度更高，重复性更好，GC-rich、AT-rich基因代表性更好的测序数据。适用于本试剂的新script支持mRNA Seq IFC 和 Open App IFC，可以从Fluidigm Script Hub下载获得。

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SMART-Seq v4 3’DE Kit酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

SMART-Seq v4 3’DE Kit
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	635040	SMART-Seq v4 3’ DE Kit	96 Rxns	￥48,565
Clontech	635041	SMART-Seq v4 3’ DE Kit	192 Rxns	￥90,089

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SMART-Seq v4 3’DE Kit—简便的高性能单细胞差异表达分析

· 升级的SMART技术—带有LNA修饰的SMART-Seq v4 oligo 加升级的配方带来更好的性能
   (灵敏度高，更好重复性，更多的GC-rich基因)
· 末端捕获流程—大部分reads集中于3’端，同时维持出色的灵敏度，缩减了差异表达分析需要
   的reads数
· 高达12个样品pool—内嵌的indexes作为细胞barcode，可以实现在每个测序lane中高达12个样品
   的pool，进一步缩短时间，降低成本

单细胞转录组研究对于研究细胞群内不同单细胞表达情况非常重要。Takara Clontech 研发了单细胞mRNA转录本末端捕获技术，该技术侧重于3’端的末端捕获，使您可以用更少的测序reads获得高品质测序数据。本试剂同样采用了领先的SMART-Seq v4 技术，结合了SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template) 技术和LNA (Locked Nucleic Acid) 技术。
本试剂除了侧重于mRNA转录本3’端外，还包含了内嵌的indexes作为Read2的细胞barcode，可以实现在每个测序lane中高达12个样品的pool，进一步缩减了时间和研究成本。本试剂可以1–10.5 μl体系起始，依赖于Illumina Nextera^® XT DNA Library Preparation Kit。本试剂设计并经验证可以用于以下测序平台的cDNA文库和测序文库制备：HiSeq^®,NextSeq^®,MiSeq^®和MiniSeq^®。

图1. 末端捕获方法简介

表1. K562单细胞pool文库主要测序数据

图2. 从K562单细胞中检测到的基因数

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PicoPLEX Single Cell WGA Kit酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

PicoPLEX Single Cell WGA Kit
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	R300671	PicoPLEX^® Single Cell WGA Kit	24 Rxns	￥5,526
Clontech	R300672	PicoPLEX^® Single Cell WGA Kit	96 Rxns	￥19,605
Clontech	R300673	PicoPLEX^® Single Cell WGA Kit	480 Rxns	￥83,325

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PicoPLEX^® Single Cell WGA Kit

· 单细胞（或<15 pg dna）起始，获得可重复结果
· 卓越的等位基因再现性
· 易于使用和自动化
· 清晰的实验结果，不论微阵列还是PCR

■ 产品说明：

通过 PicoPLEX Single Cell WGA Kit来扩增DNA，从而实现从单个细胞中获得高度可重复的文库！该试剂盒采用专利技术（U.S. Patents 8,206,913），设计、优化用于从单个细胞中扩增单拷贝基因组DNA。简单易用的单管操作流程减少了手动操作失误，显著缩短了时间并降低了背景。 PicoPLEX Single Cell WGA Kit同样适用于6 pg到50 pg的纯化gDNA，并且兼容微阵列比较基因组杂交（array CGH）分析以及PCR。

PicoPLEX Single Cell WGA 技术概要

■ 产品组成：

· Cell Extraction Buffer
· Extraction Enzyme Dilution Buffer
· Cell Extraction Enzyme
· Pre-Amp W Buffer
· Pre-Amp W Enzyme
· Amplification Buffer
· Amplification Enzyme
· Nuclease-Free Water

■ 保存

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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	634485	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian	24 Rxns	￥30,451
Clontech	634486	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian	48 Rxns	￥47,045
Clontech	634487	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian	96 Rxns	￥63,820
Clontech	634488	SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian	192 Rxns	￥114,044

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带分子标签的微量样本的链特异RNA-Seq分析
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian

· 高灵敏度：可以人、大鼠或小鼠来源的250 pg-10 ng的总RNA或10-1000个细胞起始
· 添加UMI：校正来自PCR错误、重复序列以及序列错误的读取
· 用途广泛：能分析质量较差的FFPE、LCM以及cfRNA来源的样本
· 操作简便：仅需要7.5小时即可完成文库构建
· 无缝衔接Illumina测序：直接制备多达192种index的Illumina^® -ready文库

SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian（Pico v3）设计用于从皮克级总RNA(250 pg-10 ng)中高效制备Illumina测序文库。本试剂盒采用的技术适用于高品质、部分降解及低品质RNA（如来自于FFPE或LCM样品）。升级产品与原有SMARTer 皮克级产品相比，提升了在所有Illumina测序平台的测序性能，并且还添加特别的分子条形码（UMI），从而可以消除PCR错误或duplication以及测序偏向。

本试剂盒采用一体化操作流程，保留了链来源信息，在反转录和PCR扩增过程中就可以添加indexes和接头。整个流程，包括文库构建及纯化仅需约7.5小时。
该试剂盒包含SMARTer RNA Unique Dual Index Kit – 24U (Code No. 634451)。另外也可以与SMARTer RNA Unique Dual Index Kits (Code No. 634452 & 634457，可单独购买）搭配使用，最多可构建多达192种indexes文库。

图1. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian技术流程

图2. 使用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian制备文库的结构特征

接头序列包含：通过PCR 1反应添加的可以与Illumina流动池结合生成簇的P7、P5序列（P7以淡蓝色表示，P5以红色表示），用于区分单个lane上多个样本的Index序列（Index 1 [i7] 序列连接在P7端，Index 2 [i5]连接在P5端）。并且还包括识别测序引物区域的Read 2（紫色）和 Read 1（绿色）。通过Read 1起始得到的原始RNA的反义链序列，Read 2起始获得的是原始RNA的正义链序列。其中，通过Read 2起始时，前8个碱基是UMI（深紫色），UMI之后的3个碱基（XXX）是Pico v3 Adapter衍生的序列。

表 1. 不同样本起始量的分析结果。

以0.5、1、5和10 ng人肺FFPE组织提取的总RNA起始，采用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian制备RNA-Seq文库（均做两个重复），并使用NextSeq 500进行测序。

Technote：
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SMARTer Stranded RNA-Seq Pico v3:
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页面更新：2021-03-22 16:10:38

SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	635005	SMARTer^® Stranded Total RNA-Seq Kit – Pico Input Mammalian	12 Rxns	￥15,684
Clontech	635006	SMARTer^® Stranded Total RNA-Seq Kit – Pico Input Mammalian	48 Rxns	￥46,033
Clontech	635007	SMARTer^® Stranded Total RNA-Seq Kit – Pico Input Mammalian	96 Rxns	￥63,435
Clontech	634411	SMARTer^® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian	12 Rxns	￥12,881
Clontech	634412	SMARTer^® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian	48 Rxns	￥43,794
Clontech	634413	SMARTer^® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian	96 Rxns	￥57,613
Clontech	634414	SMARTer^® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian	192 Rxns	￥103,664

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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input
Mammalian以皮克级总RNA构建Illumina链特性RNA-seq文库

· 皮克级样品起始—可以250 pg-10 ng人，小鼠或大鼠总RNA起始
· 用途广泛—可以不同品质RNA（包括FFPE/LCM样品及游离RNA）制备文库，获得高重复再现数据
· 性能提升-不增加PhiX也可获得较高的簇通过过滤百分比（FP%），识别更多转录本，重复更少
· 保留链来源信息—转录本链来源信息识别准确度高
· 快速，一体化流程—整体流程只需~6 h ，改良了buffer配方，缩短了文库纯化时间
· 无缝衔接Illumina测序—直接制备多达96种index的 Illumina^®-ready文库

SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian设计用于从皮克级总RNA(250 pg–10 ng)中高效制备Illumina测序文库。本试剂中采用的技术适用于高品质，部分降解及低品质RNA（如来自于FFPE或LCM样品）。本试剂是一体化操作流程，保留了链来源信息，并且不需要下游文库制备，在反转录和PCR扩增过程中就可以添加indexes和接头。升级产品与原有SMARTer 皮克级产品相比，提升了在所有Illumina测序平台的测序性能，并且文库纯化操作更加方便。
核糖体RNA在总RNA中占有很高的比重（~90%）。在制备文库前从总RNA中去除掉这些大量的RNA，有利于降低测序成本，提高统计数据的比对比率。但是在以微量样品起始时，如果一开始就从总RNA中去除rRNA，会造成纯化后的起始样品太少而不能制备高品质测序文库，本试剂采用专有的特异针对哺乳动物rRNA和部分线粒体RNA的探针去除核糖体cDNA（来源于核糖体RNA的cDNA片段）。采用本试剂制备的文库与前代试剂制备的文库接头配置不同，即使是使用基于双通道SBS技术的Illumina平台如NextSeq^®， MiniSeq^™，和 HiSeq^® 3000/4000测序时，不需要添加大量PhiX也可以获得高比例的簇通过过滤百分比(%PF)。每个run可以获得更多的生物学相关测序reads，这又反过来减少了测序成本。采用Pico v2 Kit同样可以获得更多的特异转录本，更低的rRNA、mtRNA比对率和重复率。此外，Pico v2 Kit包含了一种新的PCR buffer，提高了文库纯化效率。
试剂盒提供12，48，96和192次反应规格。高通量版本试剂 (Code No. 634413,634414) 包含12种反向引物，8种正向引物，最多可以构建96种indexes文库。包括文库构建及纯化的整体流程只需~6 h。

不同样品起始量解决方案：
· 10-100 ng 总RNA, 推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – Low Input Mammalian
· 100 ng-1 μg总RNA, 推荐使用SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian

图1. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian技术流程

图2. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian提高了通过过滤百分比（FP%）。如图所示，分别采用Pico v1 或Pico v2制备文库并使用NextSeq 500 或 MiniSeq平台测序。图中，蓝色图框表示未过滤（原始）reads的簇密度分布，绿色图框表示通过过滤reads的簇密度分布。图中显示了通过过滤的reads数（以百万计）和每个run的%PF。

图3. 新的SeqAmp CB PCR buffer利于磁珠-沉淀物形成。Pico v2中的PCR buffer经过重新设计可以更快、更紧密的形成磁珠-沉淀物。经过磁力分离后，在新的SeqAmp CB buffer（右）中的沉淀物比原来PCR buffer（左）中的沉淀物更紧密。紧密的沉淀物比松散的沉淀物更容易干燥，易于重悬。

图4. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian 提升了灵敏度和重复再现性。上图为以1 ng和10 ng人肺FFPE来源的总RNA起始，分别采用Pico v1和Pico v2构建文库，NextSeq 500测序数据。Panel A. 以1 ng和10 ng样品起始，分别采用Pico v1和v2构建文库的测序数据。Panel B. 不同样品起始量之间，转录本表达水平的比较分析。

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SMARTer Stranded RNA-Seq PICO：
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页面更新：2020-11-27 10:15:56

SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian酶试剂盒Takara

发表于2024年1月12日由whatman中国官网

SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian
品牌	Code No.	产品名称	包装量	价格（元）	说明书	数量
Clontech	634873	SMARTer^® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian	12 Rxns	￥17,520
Clontech	634874	SMARTer^® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian	24 Rxns	￥29,766
Clontech	634876	SMARTer^® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian	96 Rxns	￥88,161
Clontech	634877	SMARTer^® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian	192 Rxns	￥140,875
Clontech	634878	SMARTer^® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian	480 Rxns	￥290,743
Clontech	634875	SMARTer^® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian	48 Rxns	￥54,845

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SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit-
HI Mammalian—以高起始量总RNA构建Illumina测序平台链特异性RNA-Seq文库

· 保留链来源信息—转录本链来源识别准确率>99%
· 快速，简便流程-从开始到结束~ 5h
· 起始范围广—适用于人，小鼠或大鼠100 ng-1 μg总RNA
· 适用样品范围广-不同品质RNA，不同重复间均可获得可靠数据。
RIN (RNA Integrity Number) 值3-10的总RNA均可获得高质量重复数据
· 兼容Illumina测序-构建96 index Illumina测序文库，并保留链来源信息

SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian提供了从100 ng–1 μg哺乳动物总RNA构建Illumina index测序文库的快速解决方案。本试剂结合了RiboGone和SMART技术，可以无缝融合rRNA去除和链特异性文库构建过程，整个过程只需约5小时。由于rRNA约占总RNA的90%，在文库构建前高效去除这些高丰度转录本可以降低测序成本，提升数据比对率。核心SMART技术可以在RT和PCR扩增过程中添加index和测序接头，无需下游文库构建，并且可以保留链来源信息。
这些高通量试剂包含12条反向引物和8条正向引物可以生成多至96个独立index文库。整个流程-从rRNA去除到Illumina专用index RNA-Seq文库-只需约5小时。

不同样品起始量解决方案：

· 250 pg-10 ng总RNA，推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2- Pico Input Mammalian
· 10-100 ng总RNA，推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – Low Input Mammalian

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whatman (沃特曼)

英国沃特曼品牌中国官网代理

日度归档：2024年1月12日

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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian酶试剂盒Takara

SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian酶试剂盒Takara