SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit酶试剂盒Takara

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SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
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SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit ↗
 
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell Plus Kit：更胜一筹的单细胞mRNA全长分析
· 简便，基于Plate的工作流程 - 可直接以FACS或其他方法分选的单细胞起始
· 单管操作流程 - SMART-Seq Single Cell PLUS Kit包含完整的cDNA合成和文库构建流程，分别在单管中进行，减少样品损失与混淆，降低手动操作误差
· 灵敏度高和一致性好 - 非常适用于单细胞（尤其是RNA含量非常低的细胞和细胞核）RNA-Seq的研究，可检测更多基因
· 可靠的全长cDNA分析 - 性能优于许多现有的单细胞全长cDNA合成方法，例如Smart-seq2
· 增强的测序性能 - SMART-Seq Single Cell PLUS Kit整合双端特殊index（UDI），即便多个文库pool后用高通量型Illumina测序仪（如Novaseq）分析，也能得到正确结果
· 高度灵活的工作流程 - 可与自动化设备兼容
· 更高的文库产量 - 更便于使用高通量型Illumina测序仪分析（如Novaseq），或保存剩余的文库用于多次测序
 
■ 产品说明
SMART-Seq Single Cell Kit (SSsc) 和SMART-Seq Single Cell PLUS Kit (SSsc PLUS) 是Takara科学家专门研发推出的两款具有高灵敏度和高可再现性的试剂盒，适用于单细胞和单个细胞核的RNA-Seq分析。试剂盒采用oligo（dT）引物，可从一些RNA含量非常低的单细胞（如PBMC, T细胞，B细胞）直接起始，并完成全长cDNA的捕获。
 
SMART-Seq Single Cell Kit是基于经典的SMART技术优化改良而来的单细胞cDNA合成试剂盒，可以提供全长转录本的信息，支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等广受科研人员关注的研究内容，具有更高的灵敏度和再现性。此外，该试剂盒还能提供均一的gene body覆盖度，高GC含量转录本也能得到正确分析。这些改进使得SSsc更适合单细胞分析，能得到更多有效reads、更高的基因检测数，对珍贵样本的理解更透彻！这些特点使SSsc远远超过许多现有的单细胞全长cDNA合成方法，例如SMART-Seq2！
 
SMART-Seq Single Cell PLUS Kit在包含核心的cDNA合成试剂基础上，同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术（U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, and 11,072,823）及单次使用的双端特殊index（UDI），提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验。建库试剂中包含片段化酶，以实现对合成cDNA的片段化，接着利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库。在建库阶段，单管两步操作、过程中无需纯化、2 h即可建成文库！
 
 
■ SSsc：更胜一筹的单细胞全长转录组分析！
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
The SMART-Seq Single Cell Kit outperforms Smart-seq2
图1. 与Smart-seq2法的比较
 
Takara科学家以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库，分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc,18个重复)和Smart-seq2法（Smart-seq2，20个重复）合成cDNA（均进行19个PCR循环扩增），所有样本都均一化至1.75M paired-end reads，然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。
 
Panel A 根据cDNA的制备方法不同，结果也不同。相比而言，Smart-seq2结果中比对到线粒体基因组的比率较高，而检测到基因鉴别的reads数相对较少。
Panel B SMART-Seq Single Cell Kit能检测到比Smart-seq2更多的基因。
 
■ SSsc PLUS Kit：不只是一个Kit，更是完整且更胜一筹的单细胞RNA-Seq建库体验！
 
为了使单细胞cDNA合成、文库构建实验“一步”到位，我们全新推出了SSsc PLUS Kit，从此您无需再单独购买建库模块，也不用“忍受”不同厂家不同步的供货周期。
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发，构建更高品质Illumina文库
 
Takara科学家以10 pg小鼠脑total RNA起始，采用SMART-Seq Single Cell Kit完成cDNA合成。随后分别采用SSsc Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库，并比较性能差异。
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
从测试数据中可以看出，SSsc PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍，而更高的文库产量更适于高通量型Illumina测序仪，如Novaseq。
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
两种方法所建文库随后用Nextseq 500完成测序，并对TPM(Transcripts per million)≥0.1的基因数进行统计。相较于A公司文库，SSsc PLUS文库能检出更多的基因，从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息！
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
比较数据来源于Takara Bio USA, Inc.
 
SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS KitSSsc点击图片下载
 
 
产品详情请点击：SMART-Seq Single Cell Kit & SMART-Seq Single Cell PLUS Kit
 
更多实验数据：
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页面更新：2022-09-02 11:37:45