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■ 制品内容 (20 次量) |
制品内容1~9项为用于3’RACE实验的反转录用试剂,可用于20次反转录反应 (约100次3’RACE PCR反应);10~12为Control实验用试剂,可进行5次Control实验。 |
1. PrimeScript RTase (200 U/μl) |
10 μl |
2. RNase Inhibitor(40 U/μl) |
10 μl |
3. 5 × PrimeScript Buffer |
40 μl |
4. dNTP Mixture (10 mM each) |
20 μl |
5. 3’RACE Adaptor (5 μM) |
20 μl |
6. RNase Free dH2O |
1 ml |
7. 1 × cDNA Dilution Buffer II |
1 ml |
8. 3’RACE Outer Primer (10 μM ) |
200 μl |
9. 3’RACE Inner Primer (10 μM ) |
200 μl |
10. Control HL60 Total RNA (500 ng/μl)* |
10 μl |
11. 3’RACE Control Outer Primer (10 μM)* |
10 μl |
12. 3’RACE Control Inner Primer (10 μM)* |
10 μl |
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* 用于扩增Human Prohibitin (PHB) 基因。 |
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■ 制品说明 |
本试剂盒是高灵敏度、高特异性扩增cDNA 3’末端全长的试剂盒。对RNA结构进行分析时,一般先通过RT-PCR反应扩增目的区域,然后再对扩增出的目的DNA片段进行克隆、序列分析等。一般的RT-PCR反应很难得到全长的cDNA片段,然而在基因工程研究中,分析遗传基因的全长cDNA序列又是十分重要的。RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends) 法能有效地解决这一问题。3’-Full RACE Core Set with PrimeScript RTase能够通过已知的cDNA序列,高灵敏度、高特异性地扩增cDNA的3’末端的全长序列。 本试剂盒中含有完成3’-RACE操作的主要试剂。试剂盒中使用的PrimeScript Reverse Transcriptase经过了本公司的特殊改良,反转录性能良好,无RNase H活性,大大增加了反转录性能。结合使用TaKaRa LA Taq (Code No.: RR002A) 进行PCR扩增时,其3’RACE的扩增性能大大优于其他同类产品。 本试剂盒应用了套式PCR原理,增加了PCR扩增的特异性与灵敏度,可以对少量样品或低丰度的基因进行3’RACE实验,并且对长片段的3’RACE扩增具有明显优势,我们曾经使用本试剂盒成功扩增了8 kb的3’RACE DNA片段。使用TaKaRa LA Taq™ 扩增得到的PCR产物3’端附有一个“A” 碱基,其产物可直接克隆于T-Vector中。反转录引物3’RACE Adaptor Primer含有由Takara特别设计的dT区域,反转录效率高。3’RACE Inner Primer中含有BamH I酶切位点,为克隆实验提供了方便。制品中的Control RNA及Control Primer可以用于Control实验。 |
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■ 各种引物的序列 |
引物名称 |
引物序列 (5’→3’) |
3’RACE Adaptor |
含有由Takara特别设计的dT区域及Adaptor Primer部分 |
3’RACE Outer Primer |
TACCGTCGTTCCACTAGTGATTT |
3’RACE Inner Primer |
CGCGGATCCTCCACTAGTGATTTCACTATAGG |
3’RACE Control Outer Primer |
GAGTGCAGGACATTGTGGTAGGG |
3’RACE Control Inner Primer |
ATCTTTGACTGCCGTTCTCGACC |
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■ 试剂盒原理 |
进行3’RACE 实验时,首先由PrimeScript Reverse Transcriptase将Poly(A)+RNA反转录成cDNA,然后再使用TaKaRa LA Taq (Code No.: RR002A),以反转录的cDNA为模板,进行套式PCR反应。3’RACE Adaptor Primer作为反转录引物用于cDNA合成 (具体原理见图1)。 |
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图1. 3’-Full RACE Core Set with PrimeScript RTase的实验原理图 |
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1. 以Total RNA为模板,使用3’RACE Adaptor引物进行反转录反应,合成1st Strand cDNA。 2. 使用上游外侧特异性引物 (GSP1) 和3’RACE Outer Primer进行1st PCR反应。如果1st PCR反应未能得到目的产物,再使用上游内侧特异性引物 (GSP2) 和3’RACE Inner Primer进行2nd PCR反应。 3. PCR产物可以直接进行DNA测序或TA克隆。如果使用含有BamH I酶切位点的上游内侧特异性引物进行2nd PCR扩增时,可以使用限制酶 (BamH I) 对PCR产物进行酶切反应,然后克隆至相关的载体中。 |
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■ 注意事项 |
1. 同时需要进行数次反转录反应或PCR反应时,应先配制各种试剂的混合液 (Master Mix;其中包括RNase Free dH2O、Buffer、dNTP Mixture等),然后再分装到每个反应管中。这样,可使所取的试剂体积更准确,减少试剂损失,避免重复分取同一试剂。同时也可以减少实验操作或实验之间产生的误差。 2. 使用PrimeScript Reverse Transcriptase、RNase Inhibitor等酶类时,应轻轻混匀,避免起泡,分取之前要小心地离心收集到反应管底部。由于酶保存液中含有50%的甘油,粘度高,分取时应慢慢吸取。 3. 酶制品应在实验前才从-20℃中取出,使用后也应立即放回-20℃中保存。 4. 为了防止Control RNA分解,应尽量避免反复冻融。有条件的实验室建议保存于-70℃至-80℃。 5. 分装试剂时务必使用新的枪头 (Tip),以防止样品间污染。 |
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