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KAPA RNA-seq文库构建+RiboErase rRNA去除试剂盒
对去核糖体RNA(rRNA)处理后的总RNA样本进行测序，可以得到更综合的转录组信息。
文库制备前的高效核糖体RNA(rRNA) 去除可直接提升测序覆盖度，从而降低测序成本。与传统基于磁珠的捕获方法相比，带核糖体RNA去除的KAPA Stranded RNA-Seq试剂盒(针对人类/大鼠/小鼠) 核糖体RNA去除更加稳定、高效，增加了包括非编码RNA和前体RNA在内的目标转录本测序覆盖度。
产品特色
- 适用于包括FFPE在内的降解样本
- 可检测非编码及前体区域的转录本
- 性能优于KAPA Stranded RNA-Seq试剂盒
- 改进了富含GC及低丰度转录本的测序覆盖度
- 通过验证的自动化方案
- 使用KAPA 接头(Adapters)和KAPA 纯化磁珠(Pure Beads)构建
- 完整文库构建解决方案
提高低起始量样品文库构建质量
- 从有限的起始DNA中产生更多样的文库
- 使用更高的接头比例( 即adaper:insert 比例 )，可以提高文库构建效率
不同种类、起始量的样本，仍保证核糖体RNA去除的稳定性。
在不同起始量及样本质量条件下，KAPA Ribo Erase试剂盒比I系列产品和N系列产品表现更好。纵坐标代表剩余rRNA占整体比对上reads数的百分比。
A. 使用带有去核糖体RNA的KAPA StrandedRNA- Seq和I系列产品，起始量从25 ng-1000 ng的通用人类参考序列(UHR)RNA样本rRNA都可被去除。
B. 使用带有去核糖体的KAPA Stranded RNA- Seq和N系列产品同类核糖体RNA去除试剂盒，100 ng的UHR RNA样本(RIN<2.5)和FFPE样本rRNA都可被去除。
高效核糖体RNA(rRNA)去除的同时，仍可保证目标转录本的完整性。
与I系列产品基于磁珠法的流程相比，利用酶去除技术的KAPA RiboErase流程可更加高效的去除12S和16S rRNA(蓝色箭头区域)，并且增加了编码蛋白质的目标转录本区域覆盖度(红色箭头区域)。进行文库制备的样本类型为100 ng UHR。
提升复杂转录本的测序覆盖度
- 保证富含GC的转录本区域覆盖度的一致性
- 更好的检测低丰度转录本
提升富含GC部分的转录本区域的覆盖度。
文库制备使用去除核糖体KAPA Stranded RNA-Seq试剂盒(绿色)比I系列产品(橙色)及N系列产品(蓝色)在GC含量为62.8%的血红蛋白α转录本区域有着更高的均一性，并且改进了剪切位点的识别。
低丰度转录本的检测提升。
MALAT1为低表达、非编码转录本，使用100ng UHR RNA构建文库。 使用区核糖体RNA的KAPAStranded RNA-Seq试剂盒(绿色)相比I系列产品(橙色)和N系列产品(蓝色)，覆盖度更高。
卓越的测序数据质量
- 改进测序通量的同时降低测序重复率
- 整个转录组区域的覆盖度更均一
- 更多的检出基因和特定转录本
高质量测序数据的产出。
在同样比对率下，带有去核糖体RNA的KAPA Stranded RNA-Seq试剂盒有着更低的测序重复率、更高的测序覆盖度均一性和检测特异性转录本和基因一致率。这确保同一样本下KAPA试剂盒对基因表达检测灵敏度更高。
MC-CN-00376 有效期至2021-12-31
仅供研究，不用于临床诊断。
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相关应用
- Whole Transcriptome
- Transcript Discovery and Annotation
- Gene Expression
- Total RNA-Seq
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产品手册
规格明细 / 储存条件
Kits can be stored for up to 10 months at -20ºC.
Kits contain KAPA Hybridization Buffer, KAPA Hybridization Oligos (Human/Mouse/Rat), KAPA Depletion Buffer, KAPA RNase H, KAPA DNase Buffer, KAPA Dnase, KAPA Fragment, Prime and Elute Buffer (2X), KAPA 1st Strand Synthesis Buffer, KAPA Script, KAPA 2nd Strand Marking Buffer, KAPA 2nd Strand Synthesis Enzyme Mix, KAPA A-Tailing Buffer (10X), KAPA A-Tailing Enzyme, KAPA Ligation Buffer (5X), KAPA DNA Ligase, KAPA PEG/NaCl SPRI Solution, KAPA Library Amplification Primer Mix (10X) and KAPA HiFiHotStartReadyMix (2X).
规格明细
| 规格 | 描述 |
|---|---|
| Compatible Platform | Illumina HiSeq®, NextSeq® and MiSeq® |
| Library Type | RNA |
| Starting Material | High-quality Total RNA |
| Input Amount | 100 ng – 1 µg |
订货信息
KAPA RNA-Seq文库构建试剂盒+RiboErase核糖体RNA去除 （人/大鼠/小鼠） (24个反应)
- KK货号：KK8483
- 产品货号：07962282001
- 规格：24反应
KAPA RNA-seq文库构建试剂盒+RiboErase核糖体RNA去除（人/大鼠/小鼠） (96个反应)
- KK货号：KK8484
- 产品货号：07962304001
- 规格：96反应